Izbira namiznega trdega diska je pravzaprav zelo preprost postopek. Ker imajo trdi diski zelo malo specifikacij in so mnoge od njih skupne velikim skupinam pogonov, je izbrati enega veliko lažje, kot se morda zdi. Prvi korak je odločitev, ali želite notranji ali zunanji pogon, nato pa se odločite za vrsto povezave. Po tem lahko na odločitev najbolj vplivajo zmogljivost pogona, hitrost prenosa in čas iskanja.
Prva pomembna izbira pri izbiri namiznega trdega diska je, ali želite notranji ali zunanji disk. Notranji pogon je na splošno cenejši in ne zahteva dodatnih kablov ali ločenega napajanja, vendar ga morate namestiti sami. Zunanji pogon potrebuje povezavo z računalnikom in skoraj vse jih je treba priključiti ločeno, vendar so enostavni za namestitev, prenosni in pogosto pripravljeni za uporabo v nekaj minutah.
Naslednji korak je določitev vrste povezave, ki jo imate na voljo za namizni trdi disk. Notranji priključki so običajno integrirana pogonska elektronika (IDE) ali serijski priključek napredne tehnologije (SATA). Nekatere matične plošče imajo obe vrsti povezav, večina pa eno ali drugo. Če imate izbiro, se SATA na splošno šteje za boljšo izbiro. Zunanji pogoni običajno uporabljajo univerzalno serijsko vodilo (USB), firewire ali zunanjo serijsko napredno tehnologijo (eSATA). Medtem ko je USB najpogostejši slog pogona in vrat, je eSATA najhitrejši in najbolj stabilen, sledita mu firewire in nato USB.
Mnogi uporabniki izberejo namizni trdi disk glede na njegovo kapaciteto za shranjevanje. Velikost pogona se običajno meri v gigabajtih (GB) ali terabajtih (TB), pri čemer so terabajti večji. Velikosti pogona so vedno podane pred formatiranjem; po formatiranju pogon izgubi približno 10 % svoje skupne zmogljivosti.
Druga pogosta metoda izbire pogona temelji na hitrosti prenosa ali hitrosti vretena. Hitrost prenosa je, koliko časa je potrebno za premikanje shranjenih informacij med pogonom in računalnikom. Nekateri pogoni nimajo določene hitrosti prenosa, zato kupci namesto tega uporabljajo hitrost vretena. To je meritev hitrosti vrtenja shranjevalnih površin znotraj pogona. V obeh primerih, višja kot je številka, hitrejši je prenos.
Zadnja pogosta meritev je čas iskanja. Ta znesek je podan v milisekundah. Manjši kot je čas iskanja, hitreje lahko pogon dostopa do shranjenih informacij. To je eno redkih področij, kjer želite najnižje možno število. Povprečni namizni trdi disk ima čas iskanja okoli 10 milisekund.