Pri izbiri probiotičnih pijač je treba upoštevati več pomembnih dejavnikov, vključno s podjetjem, ki izdeluje izdelek, pričakovanim rokom uporabnosti pijače in vrsto probiotikov, ki jih pijača vsebuje. V večini primerov velja, da so te pijače varne in učinkovite za vse, nekatere pijače pa so narejene izključno s probiotiki za otroke. Več zdravstvenih koristi je povezanih z uživanjem probiotičnih pijač, kot so krepitev imunskega sistema, uravnavanje prebavnega sistema in zdravljenje pogostih prebavnih težav, kot je driska. Probiotični smutiji, zlasti tisti, ki so posebej izbrani za nekatere probiotike, so se uporabljali tudi za zdravljenje drozga in napihnjenosti. Strokovnjaki predlagajo, da natančno pregledate vrste probiotikov v pijači, da izberete pravega za potrebe osebe.
Pri izbiri probiotičnih napitkov sta zelo pomembna ugled in izkušnje proizvajalke. V večini primerov bodo ta podjetja imela na svojih spletnih straneh ali promocijskih brošurah objavljene informacije, v katerih bodo predstavljene njihove ugotovitve glede učinkovitosti nekaterih vrst probiotikov za posebne zdravstvene težave in kako podjetje oblikuje svoje izdelke. Običajno se vključijo tudi informacije o koristnih učinkih probiotikov na odpornost proti kislosti in prekomerni soli žolča v želodcu. Veliko ljudi se odloči, da se posvetuje s svojim zdravnikom ali farmacevtom za predloge, katero znamko probiotičnih napitkov kupiti.
Ni nenavadno, da potrošniki kupujejo probiotične smutije in pijače v velikih količinah, da prihranijo denar in zaradi udobja. V tem primeru je nujno izbrati probiotični izdelek, ki ima dolg rok uporabnosti. Visokokakovostnih probiotikov in drugih sestavin pred odpiranjem ni treba hraniti v hladilniku, če ima izdelek stabilen rok uporabnosti. Nekatere probiotične pijače lahko najdete tudi ohlajene v trgovinah in drugih maloprodajnih mestih. To je zaradi udobja in ni nujno odraz kakovosti izdelka.
Mnogi ljudje pri izbiri prave možnosti upoštevajo tudi vrste probiotikov, ki jih najdemo v pijači. Različna stanja in motnje je mogoče izboljšati z uživanjem posebnih probiotikov. Potrošniku svetujemo, da se pouči o tem, kateri probiotiki so najbolj primerni za njegove potrebe, in temu primerno izbere izdelek. Splošno pravilo je, da probiotične pijače ne vsebujejo več kot milijardo mikroorganizmov na porcijo. Izdelki, zaužiti po priporočenem datumu, morda ne bodo tako učinkoviti, kot so bili v času proizvodnje.