Izbira pravilnih hidroponskih hranil zahteva natančno analizo vrst rastlin, ki jih je treba gojiti, proračuna osebe in vrste hidroponskega vrtnarskega sistema, ki bo uporabljen. Različne rastline potrebujejo različno pH ravnovesje in nivoje dušika. Poleg upoštevanja vrste rastlin, ki jih je treba hraniti, ima vrsta hidroponskega sistema, ki bo uporabljen, vpliv na izbiro kupljenih hranil. Hidroponski sistemi so opremljeni bodisi s sistemi kapljičnega namakanja bodisi z zmogljivostmi za poplavljanje in odvodnjavanje. Vsak od teh dejavnikov je pomemben pri izbiri idealnih tekočih rastlinskih hranil za hidroponski vrt.
Vsaka vrsta rastlin pogosto zahteva posebne vrste esencialnih hranil in da bi izbrali pravo, je ključnega pomena raziskati rastline, ki jih pridelovalec namerava gojiti. Različne vrste hidroponskih hranil ponujajo edinstvene zmogljivosti, kot so pomoč pri vzpostavitvi globokih koreninskih sistemov, spodbujanje bolj aromatičnih cvetov in spodbujanje hitre rasti. Ljudje, ki želijo gojiti produktivne zelenjavne rastline, bodo verjetno izbrali možnosti kombinacije bistvenih hranil, ki so zasnovane za spodbujanje hitre rasti z visokimi pridelki pričakovanih pridelkov. Vrtnarji, ki se odločijo za gojenje cvetočih in necvetočih okrasnih rastlin, ne potrebujejo toliko hidroponskih rastlinskih hranil, bogatih z dušikom in vitamini, in bodo iskali izdelke, ki ponujajo hranila, ki so posebej koristna za te vrste neužitnih rastlin.
Pri izbiri hidroponskih hranil mora vrtnar upoštevati tudi vrsto vrtnarskega sistema, ki bo uporabljen. V večini primerov bodo informacije, priložene vrtnarskemu sistemu, ponudile predloge posebej za to vrsto sistema, pa naj bo to možnost kapljanja ali sistem z možnostjo poplavljanja in odtoka. Te informacije bodo tudi predlagale najboljša razmerja med vodo in mešanico hranil za različne vrste rastlin, ki jih priporočamo za gojenje s sistemom.
Želeni cenovni razpon je pomemben dejavnik tudi pri izbiri hidroponskih hranil. Številni vrtnarski strokovnjaki svetujejo, da je hidroponsko vrtnarjenje lahko ena najdražjih možnosti, ki so na voljo domačemu vrtnarju. Ti strokovnjaki običajno predlagajo izbiro proračuna za zaloge hranil in iskanje najboljših možnih izdelkov, ki ustrezajo dodeljeni količini. Izjemno poceni hidroponska hranila se običajno ne priporočajo, saj običajno niso narejena iz kakovostnih sestavin, vendar so možnosti z zmerno ceno pogosto primerljive kakovosti z dragimi blagovnimi znamkami višjega cenovnega razreda. Izbira pravilne hidroponske mešanice hranil je nujna za pridelavo zdravih rastlin in zagotavljanje uspešnega vrtnarjenja.