Obstaja več različnih načinov dvojnega zagona in tisti, ki ga izberete, je lahko odvisen od dejavnikov, kot so, kateri operacijski sistem (OS), ki ste ga trenutno namestili, in katere druge operacijske sisteme želite uporabljati. Dva glavna načina za dvojni zagon sta več particij na enem trdem disku ali ločen trdi disk za vsak OS. Če se odločite za namestitev več operacijskih sistemov na en pogon, boste potrebovali vrsto zagonskega nalagalnika in jih boste morda morali namestiti v določenem vrstnem redu. Nekatere operacijske sisteme je mogoče zagnati tudi neposredno z izmenljivega medija, tako da je to tudi možnost.
Preden začnete s postopkom nastavitve sistema za več zagonov, se morate odločiti, s katerimi operacijskimi sistemi želite delati. Prav tako je lahko koristno, če upoštevate operacijski sistem, ki ste ga že namestili v računalnik, saj je z nekaterimi lažje delati kot z drugimi. Prav tako se boste želeli odločiti, ali boste uporabili več trdih diskov ali več različnih particij. Vsaka od teh spremenljivk bo spremenila način, kako spremenite svoj računalnik v dvojni zagon.
Če se odločite za namestitev več operacijskih sistemov na en disk, je prvi korak običajno particioniranje trdega diska. Za vsak operacijski sistem boste potrebovali ločeno particijo. Če nameščate iz nič, se vam običajno prikaže možnost, da to storite. Nekateri operacijski sistemi imajo vgrajene sisteme za particioniranje, drugi pa zahtevajo, da za izvedbo tega koraka pridobite ločen program. Ko imate prave particije, lahko namestite svoj sekundarni OS in nato spremenite zagonski nalagalnik, da vam ponudi izbiro vsakič, ko vklopite računalnik.
Odvisno od vašega operacijskega sistema je lahko postopek namestitve sekundarnega operacijskega sistema poenostavljen. V tem primeru lahko namestite nov OS iz obstoječega sistema in nato kadar koli preklopite nanj. To je običajno lažji postopek, čeprav ste običajno omejeni na nekaj podprtih sekundarnih operacijskih sistemov.
Postopek namestitve vsakega OS na svoj trdi disk je običajno najlažji način za dvojni zagon. Ta metoda ne vključuje particioniranja, zato vsak nov operacijski sistem preprosto namestite na čist trdi disk. Nekatere operacijske sisteme je mogoče celo namestiti na varne digitalne (SD) kartice in druge vrste izmenljivih medijev. Ker ima vsak OS svoj edinstven pogon s to metodo, lahko dvojni zagon vnesete v osnovni vhodno/izhodni sistem (BIOS) vsakič, ko zaženete računalnik. To vam lahko omogoči, da se sploh izognete delu z zagonskim nalagalnikom, čeprav se lahko zaradi udobja vseeno odločite za to.