Skeniranje mrežnice, ki se uporablja skoraj izključno v visokokakovostnih varnostnih aplikacijah, uporablja vir svetlobe nizke intenzivnosti in občutljiv senzor za skeniranje vzorca krvnih žil na zadnji strani mrežnice, ki je edinstven za vsakega posameznika. Čeprav je bilo že v tridesetih letih prejšnjega stoletja znano, da ima vsako človeško zrklo edinstvene lastnosti, je bil šele leta 1930 prvi skener mrežnice na voljo za komercialno uporabo. Proizvajalo ga je podjetje EyeDentify, ustanovljeno leta 1984, ki je še vedno glavni proizvajalec teh naprav.
Med skeniranjem mrežnice mora uporabnik odstraniti očala, strmeti v določeno točko in držati glavo pri miru 10-15 sekund, potrebnih za dokončanje skeniranja. To vrsto skeniranja je zelo težko ponarediti, ker ne obstaja tehnologija, ki bi omogočala ponarejanje človeške mrežnice, mrežnica umrle osebe pa prehitro propada, da bi se lahko uporabila za lažno izogibanje takemu pregledu.
Skeniranje mrežnice je del biometrije, področja znanosti in tehnike, ki razvija načine za edinstveno identifikacijo posameznih oseb. Najbolj priljubljena oblika biometrije, ki se danes uporablja, je seveda prstni odtis, čeprav je stopnja napak pri identifikaciji prstnih odtisov včasih celo 1 od 500. A
skeniranje mrežnice se po drugi strani ponaša s stopnjo napake 1 od 10,000,000. Njegov bližnji bratranec, skeniranje šarenice, je nekoliko manj natančen in ohranja stopnjo napake približno 1 od 131,000.
Tradicionalno uporabljeno za blokiranje fizičnih prehodov, kot so tisti, ki varujejo jedra elektrarn ali vojaških objektov, se je v zadnjem času uporabljalo skeniranje mrežnice za zaščito kritičnih računalnikov in njihovih podatkov. Skeniranje mrežnice se prodaja že za 220 $, zaradi česar je dostopno vsem, ki želijo ohraniti visoko raven varnosti. Poleg tega je verjetno najbolj natančna biometrična razpoložljiva, saj tako po zanesljivosti kot natančnosti daleč presega prstni odtis.