Razkužilo za roke deluje zaradi visoke koncentracije alkohola. Vendar pa ni primeren za čiščenje vseh vrst umazanije ali zemlje. Način uporabe lahko vpliva tudi na njegove koristi.
Alkohol ubije večino bakterij, razkužilo za roke pa vsebuje veliko alkohola. Ko ga vtrite v roke približno 30 sekund, bo res odstranil številne oblike bakterij in tudi številne viruse. Izkazalo se je za zelo učinkovito proti nekaterim nevarnim oblikam bakterij, kot je na meticilin odporen Staphylococcus aureus (MRSA), ki lahko povzroči smrtonosne in zastrašujoče bakterije, ki jedo meso.
Oseba, ki uporablja razkužilo za roke, bo verjetno pokazala tudi počasnejši ponovni razvoj bakterij. Vsi ljudje imajo vedno nekaj bakterij na rokah. Razkužilo za roke po ustrezni uporabi upočasni rast bakterij na rokah. Morda ni enako učinkovit pri preprečevanju vseh mikrobov, saj se nekateri virusi širijo z vdihavanjem nosnih kapljic okuženih oseb, kot pri navadnem prehladu. Vendar je uporaba dezinfekcijskih sredstev v šolah povezana z upadom stopnje bolezni in boljšo evidenco obiska.
Drug razlog, zakaj je lahko razkužilo za roke v nekaterih primerih učinkovitejše od umivanja rok, je ta, da ga je lažje in hitreje uporabljati. Resnično učinkovito umivanje rok zahteva toplo vodo, milo, penjenje in drgnjenje približno dve minuti. Razkužilo za roke lahko nosite v majhnih stekleničkah in traja približno 30 sekund drgnjenja, da v mnogih primerih dosežete enake koristi kot milo in voda.
Vendar pa razkužilo za roke ni učinkovito za vse potrebe po čiščenju. Zaradi nekaterih bakterij je uporaba v bolnišničnih okoljih pomembna. Vendar pa ne more učinkovito očistiti rok, ko so izpostavljene krvi ali blatu.
Razkužilo za roke ni učinkovito v gostinstvu, kjer so roke med pripravo hrane pogosto mokre. Ne more učinkovito odstraniti iztrebkov na rokah zaradi slabega umivanja rok po uporabi kopalnice ali ravnanja z zelenjavo, pridelano v gnoju. Pri stiku s telesnimi tekočinami ali umazanijo je potrebno temeljito umivanje rok.
Ta izdelek tudi ne sme nadomestiti umivanja rok v bolnišnici ali v katerem koli okolju. Na splošno razkužilo za roke zagotavlja najboljše rezultate, če ga uporabite po tem, ko si temeljito umijete roke. To še posebej velja po uporabi kopalnice. Številne bolnišnice so zdaj uvedle politike, ki zahtevajo uporabo razkužil med pacienti in umivanje rok po štirih uporabah. Poleg tega si je treba vedno, ko zdravstveni delavec pride v stik s telesnimi tekočinami, umiti roke.
Razkužilo za roke ne deluje učinkovito, če ga ne uporabljate pravilno. Ljudje potrebujejo vsaj drobiček velikosti centa in bi morali biti sposobni drgniti roke skupaj 30 sekund. Če se razkužilo posuši v krajšem času, je verjetno, da ni bilo uporabljeno dovolj, in mora oseba postopek ponoviti.