Kljub običajnim konotacijam besede »prekati« se stranski ventrikli ne nahajajo v srcu, temveč v možganih. Možgani so v veliki meri sestavljeni iz gostih zbirk živčnega tkiva, možganski ventrikularni sistem pa je povezan s centralnim kanalom hrbtenjače in pomaga pri kroženju potrebne cerebrospinalne tekočine po možganih. Ta tekočina služi za zaščito možganov in omogoča možganom, da “plavajo” v lobanji in tako zmanjšajo njihovo relativno težo.
Stranski ventrikli se nahajajo v možganih, pri čemer se en prekat nahaja na vsaki hemisferi. Imajo približno podkvesto obliko, z osrednjim predelom, pa tudi s sprednjimi ali čelnimi, zadnjimi ali zadnjimi ter spodnjimi ali časovnimi rogovi. Ta ukrivljena oblika povzroči, da stranski ventrikli prehajajo skozi vse štiri možganske režnje – čelni, temporalni, parietalni in okcipitalni.
Stranski ventrikli so najvišji del možganskega ventrikularnega sistema in so največji od ventriklov. Nad sprednjimi rogovi vsakega stranskega prekata je corpus callosum, gosta masa živčnega tkiva, ki povezuje desno in levo stran možganov in jim omogoča komunikacijo. V zadnjem delu možganov zadnji rogovi prehajajo skozi okcipitalni reženj. Časovni rogovi prehajajo skozi temporalne režnje, ki se nahajajo za templji.
Na interventrikularnih odprtinah se stranski ventrikli povežejo s tretjim prekatom. Iz tretjega ventrikla se sistem nadaljuje v četrti ventrikel, ki je najnižji ventrikel v sistemu. Četrti ventrikel se nato poveže s hrbtenjačo in dokonča sistem.
Cerebrospinalna tekočina, ki kroži skozi stranske ventrikle in preostali ventrikularni sistem, opravlja več pomembnih funkcij. Poveča vzgon možganov, tako da skupna teža organa ne zdrobi spodnjih delov možganov, in pomaga vzdrževati ustrezen tlak v lobanji. Prav tako ščiti možgane pred poškodbami ob udarcu ali udarcu po glavi. Poleg tega cerebrospinalna tekočina pomaga prinesti hranila v možgane, odstraniti odpadke in pomaga vzdrževati ustrezno kemično ravnovesje.
Od štirih ventriklov se pri stranskih prekatih najpogosteje pojavijo meningiomi, ki so tumorji, ki se pojavljajo v živčnem sistemu. Ti tumorji so običajno benigni, v redkih primerih pa so lahko maligni. Meningiomi pogosto ne povzročajo nobenih simptomov. Če povzročajo težave, na primer poslabšanje vida ali medkranialni tlak, jih je običajno mogoče kirurško odstraniti.