V možganih je limbični sistem sestavljen iz več struktur, ki pomagajo uravnavati spomin in čustva. Ena komponenta tega sistema, znana kot septalna jedra ali septalno območje, je vključena v zaviranje strahu in izražanje prijetnih odzivov. Ta struktura sprejema vhod in pošilja izhodne podatke v številne dele možganov, vključno z drugimi strukturami limbičnega sistema, in talamusom, ki usmerja dohodne dražljaje iz večine senzoričnih sistemov.
Blizu središča možganov, tik pod corpus callosum, se nahajajo septalna jedra, ki se nahajajo v bližini številnih struktur, s katerimi je v interakciji. To je snop živcev, ki povezujejo hemisfere možganov. Z evolucijske perspektive se zdi, da je bilo to področje odcep hipokampusa, strukture v limbičnem sistemu, ki je vključena v spomin. Posledično obstajajo močne povezave med tema dvema regijama.
Živčne projekcije posredujejo hipokampalne povezave z možganskim deblom in hipotalamusom, ki sta vključena v samodejne procese. Zdi se, da medialni in stranski deli območja septuma uravnavajo interakcijo teh treh področij. Funkcionalno to omogoča tem jedrom, da uravnavajo tvorbo in pridobivanje spomina hipokampusa kot odziv na vzburjenje, ki ga posredujeta hipotalamus in možgansko deblo.
Območje možganov, ki sodeluje pri izražanju strahu in drugih čustev, imenovano amigdala, je prav tako regulirano prek septalnih jeder. Tako kot njegove povezave s hipokampusom, ta jedra uravnavajo interakcijo s hipotalamusom. Vzbujanje in aktivacija amigdale lahko povzročita spolno vedenje in fizični stik. Inhibicijski signali, ki jih pošilja septalno območje, modulirajo ta odziv in spodbujajo bolj diskriminatoren stik. Nekateri raziskovalci verjamejo, da ta inhibicija prispeva k oblikovanju tesnejših, dolgotrajnejših čustvenih vezi.
Deli septalnih jeder služijo kot center za nagrajevanje, kar pomeni, da ustvarja prijetne odzive na določene dražljaje. Ti odzivi pomagajo ustvariti občutek nagrade za določeno vedenje. Študije na živalih so pokazale, da ko so implantirane naprave, ki omogočajo podganam, da neposredno stimulirajo to področje, bodo to storile večkrat, da bodo doživele prijeten občutek.
Nekatere duševne motnje lahko vključujejo spremembe septalnih jeder. Ugotovljeno je bilo, da imajo posamezniki z bipolarno motnjo in shizofrenijo na tem področju nižjo gostoto celic v primerjavi z zdravimi osebami. Ugotovljena je bila tudi korelacija pri posameznikih z veliko depresivno motnjo, kjer je bilo trajanje njihove motnje povezano z nižjo gostoto celic. Ta interakcija je verjetno posledica pomena območja septuma pri čustveni regulaciji.