Proteolitični encimi se nanašajo na skupino encimov, ki razgradijo dolge molekule beljakovin na krajše kose, ki sčasoma postanejo aminokisline. Ti encimi pomagajo telesu pri prebavi beljakovin. Proteolitični encimi se naravno proizvajajo v trebušni slinavki, lahko pa jih najdemo tudi v nekaterih živilih. Prehranska dopolnila, ki vsebujejo te encime, se lahko uporabljajo za reševanje različnih zdravstvenih težav.
Papaja in ananas proizvajata naravno velike količine bromelaina in papaina, ki sta proteolitična encima. Ti encimi se naravno nahajajo v trebušni slinavki, če pa se pojavijo prebavne težave, je morda koristno, da v prehrano dodate ananas in papajo. Če telo doživlja pomanjkanje proteolitičnih encimov, lahko simptomi vključujejo prebavne motnje, plin, napihnjenost v trebuhu in neprebavljeno hrano, ki prehaja skozi blato.
Če so prebavne težave stalne in hude, je morda koristno kupiti bromelain in papain v obliki dodatka v obliki tablet. Ugotovljeno je bilo, da so ti dodatki koristni pri zdravljenju pomanjkanja encimov, vendar se ne štejejo nujno za koristne pri zdravljenju običajnih prebavnih motenj. Pri teh prehranskih dopolnilih je potrebna previdnost in morda je najbolje, da se posvetujete z zdravnikom, preden poskusite jemati dodatek.
V nekaterih primerih se je pojavila uporaba proteolitičnih encimov za zdravljenje, ki ni prebavne težave, kot je akutna bolečina, vendar še vedno potekajo nadaljnje raziskave, da bi ugotovili njegovo učinkovitost. Dvojno slepo, randomizirano preskušanje je v Nemčiji leta 1996 izvedel dr. H. Tilscher, ki je ugotovil, da mešanica proteolitičnih encimov pomaga zmanjšati kronično bolečino v vratu.
Drugo dvojno slepo preskušanje, ki ga je na Japonskem leta 1965 izvedel dr. T. Murata, je pokazalo spodbudne rezultate z uporabo proteolitičnih encimov za zdravljenje žensk, ki trpijo zaradi poporodne zatečenosti prsi. Encimi so pomagali zmanjšati nelagodje v dojkah pri doječih ženskah. Nekatere ženske v poporodnem stanju lahko na splošno ugotovijo, da je uporaba proteolitičnih encimov v pomoč pri lajšanju simptomov, povezanih s stanjem.
Nekateri zdravniki alternativne medicine trdijo, da lahko proteolitični encimi koristijo tistim, ki trpijo za revmatoidnim artritisom, lupusom ali drugimi avtoimunskimi boleznimi. Domneva se, da dodani encimi zdravijo imunske reakcije, ki jih povzročijo celi proteinski prameni, ki uhajajo v krvni obtok. V podporo tem trditvam je bilo izvedenih zelo malo kontroliranih preskušanj.
Drugi alternativni zdravniki lahko predpišejo encimske dodatke za tiste, ki trpijo za alergijami na hrano. Teorija je, da encimi delujejo tako, da zagotovijo, da se hrana v celoti in pravilno prebavi, pri čemer ostane le malo ostankov hrane, tako da se alergijske reakcije zmanjšajo ali ustavijo. Ponovno ni bilo nobenih nadzorovanih študij, ki bi podprle teorijo encimov, ki nadzorujejo alergijske reakcije na hrano.