Ekološka jajca so jajca, ki jih pridelajo kokoši, ki se hranijo s posebno ekološko krmo. Opredelitev ekološkega je odvisna od agencije, ki jo opredeljuje, in to se lahko razlikuje od kraja do kraja. Lahko rečemo, da večina organskih jajc običajno prihaja od piščancev, ki ne prejemajo hormonov, ne prejemajo rutinsko profilaktičnih antibiotikov (za preprečevanje okužbe) in ki jedo krmo, ki je pridelana ekološko. To pomeni, da krma, ki jo jedo, običajno ni obdelana s kemičnimi pesticidi ali gnojili.
Morda obstajajo tudi druge zahteve, da se jajca štejejo za ekološka. Veliko organsko znesenih jajc prihaja tudi od kokoši, ki niso omejene na majhno kletko. Tem piščancem je dovoljeno nekaj prostora za pohajkovanje in imajo lahko dnevni dostop na prostem. Vendar kokoši v prosti reji ne proizvajajo vedno ekoloških jajc. Vsekakor pa so trg tako za proste reje kot za ekološka jajca in praksa reje piščancev, ki ustrezajo obema kvalifikacijama, hitro raste.
Kupci v trgovini z živili bodo opazili povišano ceno za ekološka jajca in celo tista, ki so pravkar označena brez reje. To je zato, ker kokoši, ki niso hranjene s hormoni, seveda proizvedejo manj jajc, kokoši iz proste reje pa lahko odložijo nekaj jajc na tla, ki se v nekaterih državah morda ne smejo zakonito prodajati. Prav tako je za piščance v prosti reji, ki so v nekaterih državah lahko del ekološke definicije, potrebno več prostora za namestitev manj živali. Tako je proizvodnja jajc običajno nižja, cena ekološke krme pa je vključena tudi v enačbo, saj je dražja od krme, pridelane, ki ne ustreza ekološkim standardom.
Zagovorniki ekoloških metod pridelave menijo, da se za pridobitev ekoloških jajc splača majhno zvišanje cene. Mnogi na primer trdijo, da ker so ekološki piščanci lahko popolnoma hranjeni z žiti, čeprav to ni vedno tako, proizvedejo manj maščobna jajca in da je lahko število železa v rumenjakih ekološko pridelanih jajc višje. Drugi pogosto naveden argument je, da organska jajca nimajo nekaterih kemikalij, ki so prisotne v jajcih, proizvedenih na druge načine, in da je nemogoče oceniti škodo zaradi rednega uživanja ostankov pesticidov, hormonov in antibiotikov. Poleg tega, ko nesnice iz proste reje proizvajajo ta jajca, mnogi trdijo, da se te živali vzrejajo na način popolnoma brez krutosti.
S to zadnjo točko se ne strinjajo aktivisti za pravice živali, kot so tisti, ki pripadajo Ljudem za etično ravnanje z živalmi (PETA). PETA trdi, da ekološka pridelava morda ne zagotavlja vzreje brez krutosti, zlasti v ZDA, in da tudi jajca iz proste reje morda ne pomenijo, da se piščanci sprehajajo po svetu brez skrbi. Organizacije, kot je PETA, menijo, da te oznake puščajo preveč vrzeli, ki jih lahko pridelovalci živali še vedno zlorabijo, in da zavajajo potrošnike, da mislijo, da ne podpirajo mučenja živali, čeprav to morda ni tako.