Bakterijske spore so izjemno odporne kopije genskega materiala, ki ga lahko bakterije uporabijo za preživetje v težkih razmerah. Omogočajo, da organizmi vstopijo v stanje mirovanja, ko so izpostavljeni sovražnemu okolju. Ko se pritiski iz okolja zmanjšajo, se spore lahko aktivirajo, kar omogoči bakterijam, da se ponovno začnejo razmnoževati. Niso vse bakterije sposobne tvoriti spore, toda nekateri dobro znani patogeni, kot so antraks, tetanus in botulizem, lahko, zaradi česar so tema zanimanja in skrbi za medicinske raziskovalce.
Organizmi lahko začnejo tvoriti spore kot odziv na specifične okoljske pritiske, kot so upad oskrbe z vodo, naraščajoče temperature ali sevanje. Traja nekaj ur, da nastanejo bakterijske spore in cele kolonije ne morejo preživeti teh pogojev, toda nekateri močni posamezniki lahko pravočasno sporulirajo, da se zaščitijo. Organizmi naredijo kopijo svojega genskega materiala in ga ujamejo v trdno kapsulo znotraj celične membrane. Spore obdaja več plasti materiala, kar povečuje možnosti za preživetje.
Sevanje, visoka vročina in ekstremna suhost ne poškodujejo bakterijskih spor. Prav tako se upirajo zdravljenju z baktericidi. To lahko v primeru patogenih organizmov predstavlja veliko nevarnost za zdravje in varnost ljudi, saj lahko preživijo večino ukrepov, ki se uporabljajo za zmanjšanje okužbe. Brisanje površin z baktericidnimi mili, na primer, lahko pusti bakterijske spore nedotaknjene. Prav tako obsevanje živilskih izdelkov ne bi uničilo spor.
Za uničenje spor je običajno treba zagotoviti dolgotrajno vsebino s kemično spojino, ki lahko napade bakterijske celične stene in uniči genski material v notranjosti. 10-odstotna raztopina belila, če ostane v stiku z bakterijskimi sporami vsaj pet minut, je lahko učinkovita metoda dekontaminacije. Nekatere spore lahko preživijo tudi zunaj tega okna, kar kaže na odpornost teh struktur. Dodajanje tvorbe spor v njihov življenjski cikel je številnim organizmom omogočilo, da so zdržali zelo težke okoljske razmere, ki bi bile prehude za druge organizme.
Raziskave spor preučujejo, kako nastanejo in kako jih je mogoče obravnavati, če jih ustvarijo organizmi, za katere je znano, da povzročajo bolezni. To zahteva skrbno nadzorovana okolja, ki sprožijo nastanek spor in izpostavijo spore različnim nevarnostim. To lahko pomaga raziskavam ugotoviti, kaj bo zanesljivo uničilo bakterijske spore, tako da lahko pripravijo priporočila o protokolu okužbe. Razvijalci baktericidov za okolja, kot so bolnišnice in raziskovalne ustanove, morajo prav tako ostati korak pred svojimi cilji, saj so ti organizmi zelo prilagodljivi in lahko sčasoma razvijejo odpornost na čistilne raztopine.