Akvarijske črpalke so naprave, ki se uporabljajo za vzdrževanje zdravja akvarija in njegovih prebivalcev z zagotavljanjem kroženja vode in oksigenacije. Črpalka je pogosto majhna naprava, ki je pritrjena na zunanji del akvarija, lahko pa se tudi potopi. Zunanje črpalke so ponavadi močnejše in ne segrejejo okoliške vode, medtem ko je treba potopljene akvarijske črpalke spremljati za proizvodnjo toplote. Velikost in moč črpalke sta neposredno sorazmerni z velikostjo akvarija, pa tudi s količino vode, ki jo vsebuje. Večji rezervoar zahteva močnejšo črpalko za kroženje vode z enako hitrostjo kot manjši akvarij, opremljen z manj zmogljivo črpalko.
Celotno vodno telo vašega akvarija je treba spustiti skozi črpalko ali večkrat na uro “obrniti”. Dejanska pogostost je odvisna od vrste in gostote organizmov, ki jih nameravate hraniti v rezervoarju. To gibanje vode se meri v galonah na uro ali GPH in je pokazatelj moči akvarijskih črpalk. Če vaš rezervoar vsebuje 20 litrov vode in vaša nastavitev zahteva hitrost obračanja 5-krat na uro, boste potrebovali črpalko z oceno 100 GPH. Sistemi, ki vsebujejo koralne grebene in nekatere nevretenčarje, običajno zahtevajo močnejše akvarijske črpalke, saj mnogi od teh organizmov uporabljajo naravni tok v svojih ciklih hranjenja. Pogosto je koristno uporabiti dve manjši črpalki za velik rezervoar, ker vašemu akvariju zagotovita nekaj rezervnega črpanja vode, če se ena od črpalk pokvari.
Vodo, ki kroži skozi akvarijske črpalke, je treba spustiti skozi filtrirni sistem. To je bistveno, da voda ostane čista od odpadkov, ki jih proizvajajo organizmi, razpadajoče organske snovi in fizičnih delcev, kot je umazanija. Dve najpomembnejši vrsti filtrov, ki se uporabljata pri akvarijskih črpalkah, sta biološki filter in mehanski filter. Biološki filter je pravzaprav sestavljen iz bakterij, ki rastejo in se naselijo v rezervoarju in filtru ter odstranjujejo škodljive stranske produkte razgradnje organskih odpadkov. Pri tovrstnem filtru je najpomembnejša površina. Mehanski filter odstrani umazanijo iz vode, jo ohranja čisto in preprečuje, da bi karkoli zamašilo biološki filter.
Vsak zaprt akvarij mora imeti akvarijsko črpalko, da bi se izognili žepkom brez gibanja vode, kjer bodo alge in škodljive bakterije rasle in poškodovale ribe in rastline. Izbira prave črpalke in filtra za vaš akvarij se morda sprva zdi zastrašujoča naloga, toda s pravo količino raziskav se lahko vsakdo dobro odloči in ima koristi od tega, da svoj akvarij raste in uspeva.