Pod hipnozo ljudje redno poročajo o občutkih umirjenosti in sproščenosti ter o zmanjšanem občutku bolečine. Z uporabo slikanja možganov so raziskovalci opazili, da možganska prefrontalna skorja, ki upravlja dejavnosti, kot sta osredotočena pozornost in odločanje, pokaže izrazito spremembo svojih običajnih vzorcev, ko je oseba podvržena hipnozi. Te spremembe potrjujejo, da se dejansko doživlja manj bolečine in ni le namišljena, in da se zavedanje dejansko poveča, ko se človekova zavest spremeni s hipnozo.
Ko je um pod hipnozo, se pogosto domneva, da ljudje spijo in nimajo nadzora nad svojim vedenjem. Pravzaprav je ravno nasprotno. Pod hipnozo je kognitivni del možganov, ki se običajno ukvarja z logiko in razmišljanjem, bolj aktiven kot v nehipnotičnem stanju. Ko je človek pod hipnozo, je razmišljajoči del možganov dejansko močnejši in se tako bolje upre zasvojenemu vedenju ali prenaša bolečino, ne da bi ga ta preobremenila.
Hipnoterapija se pogosto uporablja pri zdravljenju anksioznosti in s stresom povezanih bolezni, kot sta Crohnova bolezen in sindrom razdražljivega črevesja. Raziskave potrjujejo, da je hipnoterapija uspešna pri zmanjševanju simptomov takšnih bolezni, saj duševni učinki hipnoze povzročijo globljo sprostitev. Po hipnozi ljudje občutijo tudi fizično olajšanje simptomov, ki jih pogosto povzroča stres, kot so težave s prebavili, glavoboli, nespečnost in utrujenost.
Medtem ko je oseba pod hipnozo, je občutno bolj umirjena, vendar pa lahko učinki hipnoze s pomočjo hipnotične sugestije pomagajo osebi tudi po koncu hipnoterapije. Na primer, med hipnozo je mogoče predlagati osebi, naj globoko zadiha, ko bo v prihodnosti soočen s stresom, ali da se bolj zaveda, kako se telo počuti, ko se sooči s tesnobo. Z ustvarjanjem povečanega post-hipnotičnega zavedanja lahko oseba deluje proti negativnim reakcijam tako, da namerno sprosti mišice telesa in naredi nekaj čistilnih vdihov, namesto da bi padla v nenadzorovano čustveno reakcijo, ko se sooči s prihodnjimi stresnimi situacijami.
Koristi ne občutimo le, če jih hipnoterapevt postavi pod hipnozo, ampak raziskave kažejo, da je enake reakcije mogoče doseči tudi s samohipnozo. Čustveni učinki hipnoze so se izkazali celo za zelo koristne za ženske, ki so bile podvržene biopsiji dojk, pa tudi za obvladovanje bolečine po takem posegu. Anksioznost pogosto spremlja proces biopsije dojke, ki vključuje odrezanje dela tkiva dojke za pregled. Anksioznost se čuti tudi zaradi možnosti diagnoze raka. Raziskave pa so pokazale, da je pri ženskah, ki jih vodijo k samohipnozi, manj verjetno, da bodo občutile visoko raven tesnobe, povezane s tem postopkom.