Kronične jutranje glavobole lahko povzročijo številni vzroki, med katerimi je najpogostejši škripanje z zobmi. Poleg tega so raziskave pokazale, da lahko jutranje glavobole povzročijo nekatera zdravila in zamašitev sinusov. Ženske pogosteje kot moški razvijejo to težavo, zato je mogoče poskusiti z različnimi metodami zdravljenja, da bi jo odpravili.
Nočno škripanje z zobmi je pogost vzrok za glavobole, ki se pojavijo zjutraj. Strokovnjaki običajno priporočajo, da ljudje, ki škripajo z zobmi ponoči, nosijo ščitnike za usta. Nošenje te zaščitne opreme lahko ne le pomaga pri preprečevanju kroničnih jutranjih glavobolov, ampak lahko tudi zmanjša poškodbe zob. Medtem ko je nekatere zobne ščitnike za usta mogoče kupiti v prosti prodaji, so študije pokazale, da tiste, ki jih zobozdravnik oblikuje za določenega pacienta, zagotavljajo najboljše rezultate. V večini primerov bo zavarovanje krilo stroške, povezane s temi predmeti.
Nekatera zdravila lahko zjutraj povzročijo tudi glavobol. Tisti, ki dalj časa jemljejo opiate, nekatera zdravila proti bolečinam ali celo kofein, bodo verjetno imeli jutranje glavobole, čeprav lahko bolečino povzročijo tudi druga zdravila. Posamezniki, pri katerih se glavoboli povečajo po začetku jemanja novega zdravila, bodo morda želeli poskusiti preiti na drug izdelek. Zdravnik bo morda lahko predlagal zdravilo, ki ponuja enake koristi brez podobnih stranskih učinkov.
Sinusna kongestija je pogost vzrok jutranjih glavobolov. Pogosto bodo morali tisti, ki trpijo zaradi kronične sinusne kongestije, opraviti večje oblike zdravljenja, da bi popolnoma rešili težavo. V večini primerov se bodo glavoboli znatno zmanjšali tako po resnosti kot pogostosti, ko so sinusi očiščeni.
Nekatere študije so pokazale, da imajo ženske pogosteje te glavobole kot moški. To je lahko posledica sprememb v ravneh hormonov med moškimi in ženskami, nekaterim ženskam pa celo dajejo moške hormone za zdravljenje tega stanja. Vendar se to zdravljenje običajno ne šteje za idealno za dolgotrajno uporabo, zato ga je treba uporabljati previdno.
Dehidracija je še en pogost vzrok za glavobole zjutraj, saj telo ponoči ne zaužije vode. Tiste, ki verjamejo, da bi to lahko povzročilo težavo, običajno spodbujamo, da čez dan zaužijejo veliko tekočine. V večini primerov kronično dehidracijo povzročijo velike količine telesne dejavnosti ali uporaba določenih zdravil. Poleg tega lahko izogibanje alkoholu, gaziranim pijačam in drugim pijačam, za katere je znano, da imajo diuretične lastnosti, tudi močno zmanjša možnosti za razvoj dehidracije.