Kontrolor zračnega prometa mornarice je odgovoren za usmerjanje in nadzor zračnega prometa v bližini letalonosilke ali pomorske baze. Običajno kontrolor zračnega prometa mornarice vzpostavi radijski stik samo z vojaškimi piloti, čeprav lahko kontrolorji poskušajo vzpostaviti stik s civilnimi piloti, ki zaidejo v pomorski zračni prostor. Tako kot civilni kontrolor mora tudi vojaški kontrolor dokončati visokošolsko izobrazbo in opraviti obsežno usposabljanje na delovnem mestu.
Pomorske sile v mnogih državah uporabljajo letalonosilke za prevoz vojaških letal in drugih letal na različne lokacije po vsem svetu. Piloti upravljajo ta plovila in ti posamezniki so odgovorni za prestrezanje sovražnikovih borcev in izvajanje izvidniških misij. Ker pomorski piloti pogosto izvajajo misije na oddaljenih oceanskih območjih, so na krovu potrebni kontrolorji zračnega prometa, da usmerjajo tok zračnega prometa in zagotovijo, da ne pride do trkov v zraku. Poleg tega so številne pomorske operacije strogo tajne, v tem primeru vojska običajno uporablja pomorske kontrolorje zračnega prometa in ne civilne kontrolorje, tudi če mornarski piloti delujejo v komercialnem zračnem prostoru.
Letalonosilke so nenehno v gibanju, kar pomeni, da se piloti zanašajo na kontrolorje zračnega prometa, da jih vodijo do teh ladij po končanih misijah. V primerjavi z letališči imajo mornariške fregate razmeroma malo manevrskega prostora, kar pomeni, da morajo kontrolorji zagotoviti, da so krovi prosti, preden lahko piloti dobijo dovoljenje za pristanek. Tako kot pri civilnih kontrolorjih mora tudi kontrolor zračnega prometa mornarice upoštevati vremenske razmere, preden dobi pilotsko dovoljenje za vzlet ali pristanek mornariškega letala.
Med konfliktnimi situacijami bo kontrolor zračnega prometa mornarice spremljal zračni prostor okoli ladje ali mornariške baze, da bi spremljal sovražnikove lovce, ki bi lahko predstavljali grožnjo za pomorske sile. Kontrolor mora mornariške pilote opozoriti na vse takšne grožnje. Običajno je vsaki letalonosilki dodeljen en krmilnik; kontrolorji na ladjah, ki plujejo v istih vodah, se morajo povezati med seboj, da zagotovijo, da letala njihovih ladij ne trčijo. V nekaterih okoliščinah lahko kontrolorji mornarice vzpostavijo stik tudi s piloti letalskih sil, če druge vojaške enote zagotavljajo zračno kritje pomorskih fregat.
Na splošno mora kontrolor zračnega prometa v mornarici dokončati štiriletno diplomo iz vesoljske tehnike ali podobne teme. Tako kot drugi pripadniki oboroženih služb morajo kontrolorji uspešno opraviti osnovno usposabljanje in v mnogih primerih morajo ti posamezniki preživeti več mesecev ali let na akademijah za pomorsko usposabljanje, preden se prijavijo za delovna mesta kontrolorja. Običajno se na delovna mesta kontrolorja lahko prijavijo samo uradniki.