Prehrana vodnega zmaja bi morala na splošno vključevati približno deset odstotkov zelenjave in sadja, bogate s kalcijem in fosforjem, pa tudi nekatere žuželke in hranilne živali, vključno z mladiči miši, ptiči ali ribami. Večina vodnih zmajev bo potrebovala hrano, obloženo z mineralnim dodatkom v prahu vsaj enkrat na teden, razen če jedo hrano, bogato s celim plenom. Žuželke bi morale na splošno predstavljati manjši del prehrane vodnega zmaja, saj lahko prekomerno hranjenje žuželk povzroči nevarno črevesno blokado pri vodnih zmajih. Poleg pravilne, uravnotežene prehrane mora biti večina vodnih zmajev izpostavljena UVA/UVB svetlobi približno 12 ur na dan. To omogoča njihovim telesom, da asimilirajo in uporabijo kalcij, ki ga zaužijejo.
Plazilci, kot je vodni zmaj, na splošno potrebujejo v svoji prehrani veliko kalcija, beljakovin in fosforja. Zato herpetologi na splošno priporočajo hranjenje teh živali s hrano, ki je težka za krmnice. Otroci miši, mladiči podgan, majhni ptiči in majhne ribe veljajo za dober plen za te živali. Mladi glodalci, ki so ravno dovolj stari, da jim je zraslo malo krzna, veljajo za najboljši vir beljakovin in drugih mineralov za vodne zmaje. Živali, kot so te, bi morale običajno predstavljati od 20 do 40 odstotkov prehrane vodnega zmaja.
Večina strokovnjakov priporoča hranjenje vodnih zmajev samo mrtvih glodalcev. Živi glodalci lahko napadejo vodnega zmaja ali se mu uprejo. To lahko povzroči poškodbe plazilca, okužbo in celo smrt.
Nekatere vrste zelenjave in sadja so lahko zdrav dodatek k prehrani vodnega zmaja. Jagode, fige, dinje in maline so primeri sadja, ki lahko vodnemu zmaju ponudijo veliko vitaminov in mineralov, ki jih potrebuje za dobro zdravje. Bučke, pastinak, zeleni fižol in regrat so običajno tudi prehransko primerni. Vendar pa vsi vodni zmaji ne bodo jedli te hrane. Vodne zmaje, ki ne jedo zelenjave ali sadja, lahko namesto njih nahranimo z dodatnimi desetodstotnimi hranilnicami.
Deževniki se na splošno štejejo za koristen del prehrane vodnega zmaja, saj vsebujejo velike količine beljakovin, fosforja in kalcija, ki jih vodni zmaji običajno potrebujejo. Nekateri strokovnjaki menijo, da lahko samo deževniki predstavljajo kar 20 odstotkov prehrane vodnega zmaja. Druge vrste žuželk, na splošno mokasti črvi in črički, lahko predstavljajo 40 do 50 odstotkov kuščarjeve prehrane. Mineralni dodatek za plazilce je treba običajno potresati po žuželkah vsaj enkrat na teden, da zagotovimo, da vodni zmaji v svoji prehrani dobijo dovolj kalcija in fosforja. Brez ustreznega vnosa mineralov lahko ta bitja resno zbolijo.