Znanstvena klasifikacija je sistem, ki ga biologi uporabljajo za klasifikacijo vsega življenja na Zemlji. Znana je tudi kot znanstvena klasifikacija v biologiji ali Linneova klasifikacija, po Carolusu Linnaeju (1707-1778), ki je prvi poskusil ta velik projekt. Pionirsko delo je bila Systema Naturae, prvič objavljena leta 1735, ki je potekala v dvanajstih izdajah v celotnem Linnaejevem življenju. Prva različica je imela nekaj tisoč vnosov, razvrščenih v taksone na podlagi skupnih fizičnih značilnosti. Danes znanost priznava več kot dva milijona vrst, čeprav je skupno število rastlinskih, živalskih in enoceličnih vrst na Zemlji ocenjeno na med 10 in 100 milijoni.
Sistem znanstvene klasifikacije, ki se uporablja v biologiji, je hierarhičen, z osmimi stopnjami kategorizacije. Od najmanjšega do največjega so: vrsta, rod, družina, red, razred, tip, kraljestvo in domena. Med temi ravnmi je pogosto dodanih še več delitev, saj življenje samo nima posebne obveznosti, da bi bilo naravno razvrščeno v samo osem hierarhičnih ravni. Če želite navesti primer vsakega, razmislite o položaju ljudi v znanstveni klasifikaciji. Ljudje so vrste Homo sapiens, rod Homo, družina Hominidae (velike opice), red primati, razred sesalcev (sesalci), tip Chordata (vretenčarji in nekaj bližnjih sorodnikov), kraljestvo Animalia (živali), domena Eukarya (evkarionti, organizmi z kompleksne celice).
Najvišje ravni znanstvene klasifikacije so se skozi leta večkrat spremenile. Leta 1735 je Linnaeus uvedel dve kraljestvu: Vegetabilia (rastline in glive) in Animalia. Leta 1866 je nemški biolog Ernst Haeckel uvedel še eno kraljestvo, Protista, za vse enocelične organizme. Leta 1937 je francoski biolog Edouard Chatton na podlagi podrobnejših opazovanj celic v rastlinah, živalih in bakterijah razdelil življenje na dva »cesarstva« – Prokariota in Evkariota. Izkazalo se je, da imajo rastline in živali temeljne podobnosti v kompleksnosti svojih celic in prisotnosti celičnih jeder, medtem ko bakterijam manjkajo tako jedra kot organele (znotrajcelične strukture).
Več večjih posodobitev je sledilo v 50., 60. in 70. letih, ki so bili čas hitrega napredka v biologiji. Herbert Copeland je sistem posodobil na štiri kraljestva leta 1956, ko je preimenoval Prokaryota v Monera in razdelil Eukaryota na tri kraljestva: Protista, Plantae in Animalia. Druga sprememba je prišla leta 1969, ko je Robert Whittaker Protista razdelil na Fungi in Protista, s čimer je glivam prvič dal lastno najvišjo klasifikacijo.
Leta 1977 so Carl Woese in njegovi sodelavci uvedli najbolj natrpan sistem najvišje ravni doslej s šestimi kraljestvi: Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, Plantae in Animalia. Nato je Woese leta 1990 sistem usmiljeno poenostavil in zmanjšal na tri domene: Bacteria, Archaea in Eukarya. Slednji je trenutno uporabljen sistem razvrščanja na najvišji ravni.