Zdravljenje zastrupitve z metanolom običajno vključuje odstranitev in nevtralizacijo metanola, ki je še v želodcu, nevtralizacijo metabolne acidoze in preprečevanje razgradnje preostalega metanola ter odstranitev nemetaboliziranega metanola in vseh preostalih metabolitov metanola. Ko zaužijemo metanol, telo razgradi spojino na strupene dele ali presnovke, kar povzroči metabolično acidozo, kri in druge telesne tekočine pa postanejo zelo kisle. Metabolna acidoza je lahko usodna, če se ne zdravi hitro.
Če bolnika odkrijejo kmalu po zaužitju metanola, lahko ekipa za nujne primere hitro ukrepa, da odstrani morebitni metanol, ki je še v želodcu, tako da povzroči bruhanje ali izčrpa strup. Aktivno oglje, dokaj univerzalni nevtralizator strupov, se pogosto daje, čeprav to ni praksa, ki temelji na dokazih. Na žalost aktivno oglje ni posebej učinkovito pri absorpciji metanola ali drugih alkoholov. Vsak metanol, ki ga je želodec prebavil ali je prišel v prebavni trakt pred črpanjem želodca, se bo razgradil in začel zastrupljati telo.
Druga stopnja zdravljenja zastrupitve z metanolom je nevtralizacija metabolne acidoze, ki jo povzroča presnova metanola v mravljinčno kislino. Diagnoza metabolne acidoze je težka, razen če sumite na zastrupitev z metanolom, ker so simptomi precej splošni in vključujejo bruhanje, bolečine v prsnem košu, palpitacije srca in tesnobno duševno stanje. Zdravljenje se začne z izvajanjem plina v arterijski krvi, da se preveri raven pH v telesu, ali kako kisla je kri, in raven bikarbonata ali sposobnost krvi, da blaži povišane ravni kisline. Za nevtralizacijo povišane ravni kisline bodo intravensko dajali natrijev bikarbonat za uravnavanje pH ravnovesja, folinsko ali folno kislino pa bosta pomagali presnoviti mravljinčno kislino. Pacientu bodo pogosto dajali intravenske tekočine in elektrolite, upravljanje dihalnih poti ter ga ocenili in zdravili zaradi morebitnih obstoječih nevroloških ali srčno-žilnih težav, ki so posledica zastrupitve z metanolom.
V tretji fazi zdravljenja je cilj preprečiti nadaljnjo presnovo metanola ter odstraniti nemetaboliziran metanol in morebitne preostale strupene presnovke. Alkohol dehidrogenaze so encimi, ki katalizirajo razgradnjo alkoholov in v primeru zastrupitve z metanolom omogočajo razgradnjo metanola v mravljinčno kislino. Etanol ali fomepizol se običajno daje za preprečevanje presnove metanola, ker delujeta kot konkurenčna zaviralca alkoholnih dehidrogenaz, kar pomeni, da se vežeta na alkoholne dehidrogenaze in jih pustita neaktivne in neuporabne. Posledično etanol ali fomepizol preprečita ali upočasnita presnovo metanola v njegove strupene stranske produkte, kar omogoča, da se metanol izloči skozi ledvice. Izvedena bo tudi hemodializa, da se kri očisti morebitnega preostalega metanola in mravljinčne kisline.