Zdravljenje ciste trebušne slinavke pogosto ne vključuje nobenega zdravljenja. Majhne, benigne ciste in psevdociste pogosto izginejo same, zato je pogosto dovolj pozorno čakanje, čeprav bo morda treba razmisliti o nadaljnjem zdravljenju, če povzročajo nelagodje ali druge simptome. Če ne izginejo brez zdravljenja, jih mora zdravnik spremljati, da ugotovi, ali še naprej rastejo ali kažejo kakršne koli znake, da postanejo rakavi, v tem primeru bo morda potrebna biopsija. Velike ciste ali tiste, ki se sčasoma povečajo in povzročajo težave bolniku, bo morda treba izsušiti z iglo. Morda bodo zahtevali tudi kirurško odstranitev, zlasti če obstajajo znaki, da bi se lahko spremenili v raka.
Za mnoge bolnike bo cista trebušne slinavke – ki morda ni prava cista, ampak psevdocista, ki nima specializiranih celic, ki izločajo tekočino v prostor, ki ga zasedajo -, izginila brez zdravljenja. Mnogi zdravniki raje uporabljajo metodo, imenovano budno čakanje, kjer se ne zdravi in se cista spremlja glede sprememb. Pogosto se benigna cista razreši v šestih tednih in ni potrebna nobena intervencija.
Cista trebušne slinavke, ki vztraja po običajnem obdobju budnega čakanja, morda še vedno ne zahteva zdravljenja, vendar običajno zahteva spremljanje. Ciste v trebušni slinavki lahko sčasoma narastejo in ko postanejo večje od 2 centimetra, lahko povzročijo bolečine v hrbtu ali trebuhu, zlatenico ali se celo okužijo. Lahko postanejo tudi predrakave ali rakave. Trenutne ciste mora zdravnik redno pregledovati, da se prepriča, da ne povzročajo težave.
Drenaža je včasih zdravljenje velike, simptomatske ciste trebušne slinavke, zlasti pri starejših bolnikih, ki morda niso dovolj zdravi za operacijo. To se običajno naredi z zagonom endoskopa, ki je fleksibilna cev, ki je lahko opremljena z iglo za odvajanje, v usta in navzdol do trebuha. Tam bo igla vstavljena v cisto, da izvleče tekočino iz notranjosti.
Kirurgija je pogosto dobra možnost za zdravljenje ciste trebušne slinavke. Mladi, zdravi bolniki imajo morda raje to možnost kot drenažo, saj je pogosto najučinkovitejši pristop. Običajno je tudi najboljša metoda, če biopsija pokaže, da lahko cista postane rakava. Ko se cista trebušne slinavke kirurško odstrani, so možnosti, da se vrne, precej nizke.