Kaj je zapis genoma?

Oznaka genoma označuje dele genoma z informacijami o genskih podatkih, ki jih vsebuje. To je del procesa pri projektih genoma, kjer cilj ni le sekvenciranje DNK ciljnega organizma, ampak razumevanje, kaj počne in kako deluje. Raziskovalci lahko v svojih laboratorijih izvajajo opombe in lahko podatke delijo z drugimi znanstveniki, da združijo vire in informacije. Spletne baze podatkov, ki so odprte za javnost, so na voljo, nekatere pa tudi širši javnosti omogočajo, da predložijo svoje pripombe.

Prvi korak pri označevanju genoma je sekvenciranje, kjer raziskovalci določijo vrstni red aminokislin v DNK organizma. Zaporedje celotnega genoma traja dolgo in običajno je, da znanstveniki začnejo pripisovati, preden je genom dekodiran. Z odsekom sekvencirane DNK v roki lahko raziskovalec začne komentirati. Znanstveniki lahko opazijo, kje se zdi, da se geni začnejo in ustavijo, pri čemer so pozorni na značilne nize DNK, ki vsebujejo informacije o delovanju genoma.

Računalniki so sposobni sami izvajati nekaj zaznamkov genoma. Iščejo lahko znane vzorce, kot so nizi aminokislin, ki se pojavijo na začetku in koncu genov. Pri avtomatiziranem označevanju lahko računalnik doda opombe različnim delom niza DNK, da zagotovi informacije o tem. Možno je tudi primerjati segmente različnih organizmov, da bi poiskali variance, ki bi lahko zagotovile pomembne informacije o vrsti kot celoti.

Ročno beleženje genoma vključuje fizični pregled DNK. Mnogi raziskovalci uporabljajo računalnike za prikaz informacij in njihovo označevanje, kar jim omogoča, da jih med delom vnesejo v baze podatkov. V nekaterih primerih bo morda potreben ročni pregled po samodejnem označevanju, da se prepričate, ali je računalnik pravilno prejel informacije. To je lahko naporen proces in napake se pojavljajo, kar je eden od razlogov, zakaj raziskovalci radi združujejo baze podatkov. Če se pripis ne ujema z drugimi na istem delu DNK, lahko ljudje ocenijo informacije, da ugotovijo, kaj se je zgodilo, in odpravijo napako.

Med postopkom označevanja genoma ni vedno mogoče ugotoviti, kaj počne gen. Znanstveniki lahko označijo gene in jih ločijo od drugih komponent genoma, kot so nekodirajoče ponovitve DNK. Te informacije je mogoče uporabiti v raziskavah, ko ljudje razvijajo teorije o različnih segmentih genoma. Pripisom lahko dodajo, da zapišejo funkcijo gena.