Postopek pridobivanja molibdena je odvisen od zakonov na lokacijah znotraj države, kjer so bile odkrite žile rude. Če se ruda nahaja globoko, se izkopljejo podzemni rudniki. Če je na površini ali na majhni globini, se uporabljajo tehnike površinskega rudarjenja. Ameriška agencija za varstvo okolja je dober vir za informacije o črpanju molibdena. Ko v Združenih državah Amerike odkrijejo rudo blizu površja, je postopek za pridobivanje molibdena naslednji: očistite mesto grmičevja in zgornje plasti zemlje, odstranite rudo in obnovite lokacijo v prejšnji videz.
Molibden, imenovan tudi mol, je element 42 v periodnem sistemu elementov, grafikonu, ki navaja različne vrste atomov, ki obstajajo, in značilnosti, ki jih ima vsak. Molibdenova ruda ali molibdenit je spolzka na dotik in pušča črno sled, ko se premika po svetli površini. Mnogi so ga prvotno zamenjali za svinec. Leta 1781 je Peter Jacob Hjelm izoliral molibden kot čisti element, ki spada v isto kemično družino kot krom in volfram, elementa, znana po trdnosti in toplotni toleranci.
Molibdenit so locirali in kopali na Kitajskem, v ruskih državah, Čilu, Kanadi, Peruju in v Združenih državah Amerike blizu celinske ločnice. Rudniki lahko dajejo različne izdelke ali kombinacije proizvodov: molibden samo v primarnih virih, bakrove rude v virih stranskih proizvodov ter molibden in baker v virih soproizvodov. Iskalci za rudarjenje molibdena vrtajo v predlagana raziskovalna mesta in izvlečejo vzorce jedra vsakih nekaj tisoč čevljev (1000 ft = približno 305 m). Ti valjasti vzorci so odstranjeni z več sto metrov (100 ft = približno 30.5 m) v skalo.
Prvi korak pri rudarjenju molibdena je uporaba bagra z vlečnim vlečnim motorjem. Bager, težak na tisoče ton, je videti kot velikanski premikajoči se žerjav z vedrom, pritrjenim na konec njegovega nosilca. Z uporabo vrvi in škripcev se vedro vleče po tleh, pobira rastline, vrhnjo zemljo in na koncu skalo. Ko je vsa ruda pridobljena, se bager premakne na novo lokacijo in ponovi postopek.
Ko je ruda odstranjena z žlico bagra, jo odvržejo v bližnje, velikega premera, izdolbene vrtine. Visokotlačna voda je prisiljena nad rudo, da tvori kašo kamnin, ki jo odsesajo cevi s premerom 2 cm in pošljejo v mlin v predelavo. Kosi kamnine, odstranjeni z mesta, na poti do mlina, so lahko v premeru do 60.96 palcev (9 cm).
Naslednji postopek je benefikacija, pri kateri se kamnine zmeljejo in nato ločijo na rude in odpadne produkte. Benefikacija je sestavljena iz treh delov: pranja, ločevanja po gostoti za odstranjevanje magnezijevih oksidov in flotacije. Ostanki rude se dajo skozi ponavljajoče se cikle izpiranja, drobljenja s krogličnimi mlini in kalitve skozi sita, dokler ne nastane koncentrirana šarža, ki je sestavljena večinoma iz molibdenitne rude v obliki molibdenovega disulfida. Molibdenit je edina molibdenova ruda, ki se zlahka loči s postopkom floatacije, verjetno zaradi tega, kako se kot fin delec odbija ali pa ga odbijajo molekule vode.
Molibdenov disulfid se s segrevanjem na zraku spremeni v molibdenov oksid. Žveplo se odstrani kot plin žveplov dioksid. Čeprav je molibdenov oksid običajno izvozni izdelek iz pridobivanja molibdena, ga je mogoče spremeniti v molibden s segrevanjem v prisotnosti vodikovega plina. Kisik v molibdenovem oksidu se veže z vodikom in tvori raztopino vode in čistih atomov molibdena.