Velika kuga je bila zadnji večji izbruh bubonske kuge v Veliki Britaniji v letih 1665 in 1666. Zdravljenja ali zdravila ni bilo na voljo, žrtve pa so bile v karanteni v svojih domovih. Uradni zapisi navajajo 68,576 smrti zaradi kuge, vendar je umrlo na tisoče žrtev brez dokumentov, večina strokovnjakov pa se strinja, da je dejansko število smrti približno 100,000.
Bubonska kuga je bila dobro poznana prebivalcem Anglije iz 17. stoletja. O črni smrti 14. stoletja, ki je zajela Evropo in ubila skoraj tretjino prebivalstva, se je še vedno veliko razpravljalo, izbruhi pa so bili vsakoletni pojav. To je bila strašna bolezen brez zdravila, ki je hitro prevzela telo z bolečinami in zvišano telesno temperaturo ter ubila žrtev v nekaj dneh.
Čeprav je bila bolezen dobro znana, ni bila dobro razumljena. Obstajajo številne priljubljene teorije okužbe, od katerih ima vsaka svoje priporočene preventivne ukrepe. Nosegays so vohali, da bi preprečili strupe v zraku, in živali, ki so veljale za potencialne prenašalce, so ubili. Prižigali so ognje, da bi zažgali okužbo, in verjeli so, da pomaga tobačni dim. Drugi so se obračali k Bogu v molitvi ali pa so se obrnili na vraževerje in so za zaščito nosili čarobne amulete.
Pravzaprav so bolezen prenašale podgane oziroma bolhe, ki so živele na podganah. V letih pred veliko kugo je londonska populacija cvetela, rasla pa je tudi populacija podgan. Ko je mačk in psov, za katere se je takrat verjelo, da so prenašalci bolezni, pokončalo na desettisoče, se podgane niso več soočale z mestnimi plenilci, kar je omogočilo, da se populacija podgan neomejeno povečuje.
Velika londonska kuga se je začela tik pred mestnim obzidjem, v župniji St. Giles-in-the-Fields. Prvi primer so odkrili aprila 1665. Do konca maja se je število žrtev povečalo na 11. Te žrtve so bile zaklenjene v lastnih domovih, na vratih pa je bil naslikan rdeč križ. Kljub temu se je število primerov v St. Giles-in-the-Fields še naprej povečevalo in do julija je bila bolezen znotraj mestnega obzidja.
Potem ko je bila hiša označena s križem, je bila vsa družina v karanteni. Brez upanja na ozdravitev ali okrevanje je bila to smrtna obsodba. Da bi preprečili, da bi ljudje pobegnili iz domov v karanteni, so bili postavljeni stražarji. Trupla so ponoči pustili na ulici za zbiranje. Moški z vozički so zaklicali »Odpeljite svoje mrtve« in odnesli trupla v eno od kužnih jam.
Do septembra 1665 je velika kuga dosegla svoj vrhunec z več kot 8,000 uradnimi poročili o smrti tisti mesec. Hladno zimsko vreme je prineslo oddih bolezni, vendar so se smrti nadaljevale do leta 1666, zlasti v obrobnih skupnostih. Končno se je do septembra 1666 zdelo, da je izbruha konec. Po naključju se je v tem mesecu zgodil veliki požar v Londonu, vendar se ne zdi, da je požar končal veliko kugo.