V biologiji je domena najvišja možna klasifikacija organizmov. Po sodobnem sistemu, imenovanem tridomenski sistem, ki ga je leta 1990 ustvaril Carl Woese, obstajajo trije: Eucaryota (evkarionti), Archaea in Bacteria. Starejši sistemi vključujejo sistem dveh imperij, Prokariota in Evkariota, ter sistem šestih kraljestev, ki navaja Protista, Archaebacteria, Eubacteria, Fungi, Plantae in Animalia. Na podlagi genetske analize in previdnih argumentov se je večina znanstvenikov strinjala, da sedanji sistem najbolje razvršča raznolikost življenja.
Woesejev sistem je bil pohvaljen zaradi poudarjanja mikrobne raznolikosti in prepoznavanja temeljnih razlik med arhejami in bakterijami, kar je dovolj, da jih upravičijo na različnih področjih. Sistem dveh imperij naj bi prezrl te razlike, medtem ko sistem šestih kraljestev preveč poudarja posebnost gliv, rastlin in živali, ki so vsi evkarionti, sestavljeni iz kompleksnih celic z organeli in jedri. Vse večcelične živali so evkarionti.
Najbolj temeljna delitev v vsem življenju je delitev med prokarionti ali preprostimi celicami in evkarionti ali kompleksnimi celicami. Razlike v genih 16S rRNA med prokarionti so jih pripeljale do tega, da so jih razdelili na skupine arhej in bakterij, medtem ko drugi genetski kontrasti jasno kažejo razliko med temi skupinami in evkarionti.
Trenutno ni znano, katera domena je najstarejša linija organizmov na svetu, čeprav nedavni dokazi kažejo na arheje. Glede na biomaso so bakterije najštevilčnejše, verjetno sledijo arheje, nato evkarionti. Če bi bakterije in arheje izginile, bi evkarionti verjetno izumrli, ker je večina evkariontov tesno odvisnih od teh drugih organizmov za hrano ali simbiotske interakcije, kot je fiksacija dušika. Pri ljudeh so simbiotične želodčne bakterije potrebne za razgradnjo kompleksnih ogljikovih hidratov.
Archaea je najnovejša skupina, ki je bila priznana in je bila identificirana kot ločena leta 1977. Prvotno so bili ti organizmi najdeni v ekstremnih okoljih, kot so vroče vrelci v parku Yellowstone, od takrat pa so jih našli praktično povsod. Arheje vključujejo nekatere najbolj impresivne ekstremofile, kar pomeni organizme, ki uspevajo v ekstremnih temperaturah, kislosti, tlaku, koncentraciji sladkorja, pomanjkanju kisika ali drugih spremenljivkah.