Terapija s srčnimi matičnimi celicami se uporablja za zamenjavo in popravilo poškodovanih celic v krvnih žilah ter stenah komor in krvnih žil srca. Terapije, ki uporabljajo bolnikovo lastno srčno tkivo, ki je stimulirano za ustvarjanje izvornih celic, so od leta 2011 v fazi testiranja in medicinske študije. Eno od glavnih medicinskih področij, ki uporabljajo zdravljenje s srčnimi matičnimi celicami, je popravilo škode, ki jo človeškemu srcu povzročijo srčni napadi in degenerativna srčna bolezen.
Postopek zaključka terapije s srčnimi matičnimi celicami se začne z odvzemom majhne količine tkiva iz srca osebe, ki je doživela srčni infarkt ali ima poškodbe srčnih celic zaradi bolezni srca. V laboratorijskem okolju se pobrano tkivo razdeli, da dobimo matične celice, ki jih v dveh mesecih po začetku procesa spodbudimo, da se razmnožijo v več milijonov matičnih celic. Zrasle matične celice se nato vrnejo pacientu in vstavijo v poškodovano območje srca s pomočjo katetrskega balona, da dobijo dostop do votlin organa.
Nekatere vrste srčnih celic so usmerjene v terapijo z matičnimi celicami, za katere je znano, da se dobro odzivajo na rast v laboratoriju. Kardiomiocitne celice se popravijo in nadomestijo pri zdravljenju s srčnimi matičnimi celicami in so pomembne, saj sestavljajo mišico, ki premika kri iz srčnega ventrikla. Terapija se uporablja tudi za popravilo celic, ki sestavljajo notranjo oblogo in stene novih krvnih žil. Po poškodbah, ki jih celicam povzročijo bolezni srca, so matične celice, ki spodbujajo razvoj novih krvnih žil, pomembne pri oskrbi srca s krvjo in kisikom.
Poskusi vnosa matičnih celic v poškodovano srce darovalca ali človeškega zarodka so se od leta 2011 v večini primerov izkazali za neučinkovite. Uporaba tkiva za gojenje matičnih celic, ki se kasneje vrnejo prvotnemu darovalcem, se je izkazala za učinkovitejšo pri vračanju inducirane pluripotentnosti. matične celice v telo, ki popravljajo poškodovana področja srca. Postopek zdravljenja s srčnimi matičnimi celicami naj bi bil učinkovitejši kot uporaba celic kostnega mozga za popravilo sten komor in krvnih žil srca.
Terapija s srčnimi matičnimi celicami je postala kontroverzna po izpopolnitvi postopka odstranjevanja matičnih celic iz človeških zarodkov. Sposobnost razvoja matičnih celic iz tkiva končnega prejemnika je odpravila veliko polemik od leta 2011, saj je ta novi razvoj odstranil uporabo izvornih celic človeških zarodkov iz procesa. Medicinske raziskave zdravljenja z matičnimi celicami ostajajo sporne z aktivisti za pravice živali, ker imajo laboratorijske živali srčne napade in srčne bolezni, ki jih povzročajo, da bi ponovile človeške srčne težave.