Bočna vdolbina je parni podaljšek možganov človeških možganov v medulo. Medula v veliki meri deluje za uravnavanje telesnih avtonomnih sistemov. Velik del obdelave malih možganov je mogoče obravnavati kot subkognitivne, na primer prepoznavanje glasu in zaznavanje telesnega prostora. Čeprav so predvsem nevronske, parne povezave služijo tudi kot cevi za izmenjavo cerebrospinalne tekočine med možgani in hrbtenjačo. Nevrologi verjamejo, da bočne vdolbine omogočajo hitro povratno zanko zunanjega dražljaja do avtomatskih, skoraj refleksivnih motoričnih funkcij, vključno z mišičnimi kontrakcijami, ki človeka usmerjajo pokonci in ki izvajajo naučene gibe.
Celoten osrednji živčni sistem, vključno s hrbtenjačo, je v cerebrospinalni tekočini, ki zagotavlja blazino, vzgon in kemično stabilnost. Tekočina se proizvaja v štirih možganskih komorah, imenovanih ventrikularni sistem, ki so povezani z odprtinami, imenovanimi foramine. Četrti ventrikel v obliki diamanta, ki se nahaja v zgornjem delu možganskega debla, ima cevaste izbokline – stransko vdolbino – katere stranske odprtine omogočajo, da tekočina teče naprej v celotno osrednjo kanalsko ovojnico hrbtenjače in tudi v cisterno, imenovano subarahnoidalni prostor.
Poimenovana Luschkina odprtina po anatomu Hubertu von Luschki, sta dve terminalni odprtini stranske vdolbine, kot tudi ena tretja sredinska odprtina, imenovana Megendiejev foramen, kritični vodi za krvno-možgansko pregrado. Gobast subarahnoidalni prostor, ki je bil primerno poimenovan po občutljivi pajkovi mreži vezivnega tkiva in cerebrospinalni tekočini, ki je v njem, se širi, da obdaja celotne možgane in služi za zaščito okoliškega žilnega tkiva. Bočna vdolbina in odprtina sta zelo majhnega premera, zato se lahko zlahka zamašita, kar vodi v resno stanje izgradnje ventrikularnega tlaka, ki se imenuje hidrocefalus. Če se subarahnoidalni prostor vname zaradi okužbe ali krvavitve, se lahko kontaminacija zaplete v ventrikulitis ali meningitis.
Mali možgani, zgiban majhen globus možganske snovi, se nahaja pod in proti zadnji strani večjih možganskih možganov. Čeprav je odgovoren za nekatere osnovne kognitivne funkcije, vključno s pozornostjo in prepoznavanjem govora, so mali možgani najpomembnejši za prostorsko koordinacijo, natančnost in čas gibanja človeških mišic. Streha četrtega ventrikla možganov je osnova malih možganov. Njegove stranske stene tvorijo cerebelarni pedunki, stranska vdolbina pa se razteza skozi spodnji pecelj malih možganov do medule ali možganskega debla, ki uravnava avtonomno, nehoteno presnovno aktivnost, kot so dihanje in srčne kontrakcije. Debeli snopi živčnih vlaken spodnjega peclja učinkovito povezujejo in posredujejo funkcije malih možganov in medule.
Spodnji cerebelarni pecelj in stranska vdolbina, ki jo vsebuje, lahko izmenjujeta bimodalne vhodne in izhodne signale med malimi možgani in medulo. Med njegovimi glavnimi živčnimi vlakni je tudi spinocerebelarni trakt, ki prenaša proprioceptivne podatke iz celega telesa – njegovo pozicioniranje glede na prostor. Mali možgani, ki se na primer naučijo mišičnih zahtev pokončnega stojanja, morajo samodejno sodelovati z medulo, da ustrezno prilagodijo dihanje in krvni tlak, da se prilagodijo pokončnemu položaju.