Poleg zgornjih dihal sestavljajo dihalni sistem spodnji dihalni trakt. V padajočem vrstnem redu se začne s sapnikom, ki je znan tudi kot sapnik. Sapnik se razdeli na dva glavna bronha in vsak po en bronhi vstopi v enega od para pljuč. Ko se bronhi razvejajo in postanejo manjši v pljučih, sčasoma omogočijo izmenjavo plinov. Mesto izmenjave kisika in ogljikovega dioksida je znano kot dihalna cona.
Na vrhu spodnjih dihalnih poti je sapnik. Povezuje grlo nad njim z glavnimi bronhi. Je prožna, votla cev, ki se lahko raztegne z gibi vratu. Ima tudi niz čvrstih hrustančnih obročev, ki preprečujejo, da se med dihanjem sesede. To bi se sicer lahko zgodilo zaradi sprememb zračnega tlaka, ki premikajo zrak v pljuča in iz njih.
Dva glavna bronha se odcepita od sapnika. Vsak nosi zrak v ločena pljuča. Skupaj tvorita glavo tako imenovanega bronhialnega drevesa. Bronhialno drevo vsebuje mrežo vse manjših bronhijev, ki se najprej ločijo od glavnih bronhijev. Sčasoma se končajo v strukturah, imenovanih bronhiole, ki so izjemno majhne.
Bronhiole so skoraj najmanjši del spodnjih dihalnih poti. Na najbolj oddaljenem in najmanjšem koncu bronhialnega drevesa so alveole. To je mesto, kjer kisik iz zraka vstopi v kri, ogljikov dioksid pa prehaja v z zrakom napolnjene alveole. Tu ti plini vstopajo in izstopajo skozi izjemno majhne krvne žile, ki so izpostavljene zraku.
Pljuča so odgovorna za premikanje zraka po zgornjih in spodnjih dihalih. Pritegnejo zrak, ko se mišice zaradi krčenja razširijo. Razlika v zračnem tlaku, ki nastane, povzroči, da se zrak vleče v pljuča. Po razširitvi se naravno umaknejo pred naslednjim vdihom navznoter.
Spodnja dihala lahko prizadenejo številne bolezni in motnje. Kronični bronhitis negativno vpliva na normalno izmenjavo plinov in se pojavlja predvsem pri kadilcih. Pljučnica, ki jo povzročajo virusi ali bakterije, lahko resno poslabša dihanje, saj povzroči nabiranje tekočine v dolgih in je pogost vzrok smrti pri bolnih ljudeh. Tuberkuloza, ki jo povzroča bakterijska okužba v pljučih, ima oslabitveni učinek na telo s ponavljajočimi se izbruhi. Emfizem običajno povzroči kajenje in ga zaznamuje trajna poškodba alveolov.