Peptidi so organske molekule, v katerih je več aminokislin povezanih s peptidnimi vezmi. Vsaka aminokislina ima drugačno stransko verigo. Vse aminokisline so sestavljene iz amino skupine, ki je NH2, in karboksilatne skupine, ki je COOH. Ko te skupine reagirajo, ustvarijo peptidno vez. Ko se izvaja kemično zunaj celice, je peptid znan kot sintetični peptid.
Dipeptid vsebuje dve aminokislini in ima eno peptidno vez, tripeptid pa tri aminokisline in dve peptidni vezi. Dogovor je, da so verige aminokislin do 50 aminokislin znane kot peptidi, daljše pa kot beljakovine. Glavna razlika pri izdelavi sintetičnega peptida je, da se aminokisline dodajajo iz karboksilatnih skupin naprej. V celicah začnejo ribosomi sintetizirati peptide z amino skupino.
Najpogostejša metoda izdelave sintetičnih peptidov je uporaba sinteze peptidov v trdni fazi. To omogoča tvorbo sintetičnega peptida, ki ga v naravi ne bi bilo, kot so tisti, ki vsebujejo nenaravne aminokisline. S to metodo se peptidne verige imobilizirajo na poroznih kroglicah. Aminokisline so obdelane z zaščitnimi skupinami Fmoc ali Boc, da jih zaščitimo pred neželenimi reakcijami.
Peptidi so podvrženi ponavljajočim se ciklom spajanja in odstranjevanja zaščite. Kadar ni zaščiten, ima peptid, vezan na trdno fazo, prosto amino-terminalno skupino, ki je povezana z dušikom zaščiteno aminokislinsko enoto. Nato se ta enota odstrani in lahko nadalje reagira, da pritrdi drugo aminokislino. Ko je peptid dokončan, ga odcepimo od smole in očistimo s HPLC z reverzno fazo. Postopek izdelave sintetičnega peptida je mogoče skleniti s številnimi podjetji.
Sinteza peptidov se izvaja za različne raziskovalne cilje. Nekateri raziskovalci želijo preveriti, ali so pravilno določili strukturo naravno prisotnih peptidov. Drugi izvajajo študije strukture/funkcije biološko aktivnih beljakovin in peptidov. Takšni peptidi vključujejo hormone in številne toksine. Sintetični peptidi se pogosto uporabljajo kot sonde za preučevanje aktivnih delov beljakovinskih molekul.
Peptidi so pomembni pri masni spektrometriji, saj pomagajo ugotoviti, ali je raziskovalec izoliral določen protein. Vsak protein se razgradi v vzorec edinstvenih peptidov, ki jih je mogoče zaznati z masno spektrometrijo. Postopek tvorbe protiteles proti beljakovinam pri živalih je s pojavom sinteze peptidov postal veliko lažji. Ni treba skrbno prečistiti beljakovin in jih uporabiti za tvorbo protiteles. Lahko sintetiziramo peptid v fragment proteina in nato ta peptid uporabimo kot vir protiteles.
Posebno aktivno področje raziskav sintetičnih peptidov vključuje razvoj novih terapevtskih tehnik, kot so nova cepiva. Sinteza peptidov se uporablja za ustvarjanje knjižnic peptidov za pregled njihovih bioloških lastnosti. Razvili so peptide, ki prodirajo v celice, ki lahko v celice vnesejo različne dejavnike, vključno s peptidi, beljakovinami in gradniki DNK. Takšne tehnike imajo velik potencial kot sistemi za dajanje zdravil.