Kaj je RNA promotor?

Promotor RNA je zaporedje nukleotidov pred genom, ki kodira ribonukleinsko kislino (RNA). To zaporedje se nahaja v deoksiribonukleinski kislini (DNA) celice in tako kot vsi promotorji tudi RNA promotor pomaga olajšati transkripcijo genov. Razlika med to vrsto promotorja in drugimi vrstami promotorjev je v tem, da medtem ko mnogi geni, ki sledijo promotorju, kodirajo spominsko RNA (mRNA), se geni, ki sledijo RNA promotorski kodi za ribosomsko RNA (rRNA), uporabljajo v ribosomih za pomoč pri prevajanju mRNA v beljakovine. Promotorji RNA se nahajajo v genetskih informacijah vseh evkariontskih celic, zato jih imajo vsi organizmi razen bakterij in virusov. Ta promotor lahko prepoznajo proteini, ki se vežejo tako na njegovo nukleotidno zaporedje kot na encim, odgovoren za transkripcijo, kar pospešuje hitrost transkripcije.

Promotor RNA zagotavlja svojo funkcijo tako, da zagotavlja vezavno mesto za RNA polimerazo I, encim, ki prepisuje rRNA, kot tudi povezane transkripcijske faktorje. Zaporedje promotorja na DNK je drugačno od večine genov, ki uporabljajo timinsko in adeninsko serijo nukleotidov, imenovano škatla TATA. Namesto tega ima promotor RNA zaporedje, imenovano upstream control sekvenca (UCS), ki jo prepozna protein, imenovan upstream binding factor (UBF). Ko se vežejo, nastane večji proteinski kompleks, imenovan transkripcijski iniciacijski faktor-IB (TIF-IB). TIF-IB je sestavljen iz TATA veznega proteina (TBP), ki se uporablja v drugih promotorjih, kot tudi iz drugih encimov transkripcijskih faktorjev. Drugi prisotni encimi pomagajo, da se TBP veže na UBF, saj, kot je omenjeno zgoraj, na sekvencah DNK, ki kodirajo rRNA, ni škatle TATA, na katero bi se lahko vezal.

Potem ko je kompleks TIF-IB vezan navzgor od gena, ki kodira rRNA, se fosforilira, kar aktivira kompleks in mu omogoči, da pridobi in veže RNA polimerazo I. To je edini encim, ki je sposoben prepisati zaporedje DNA, ki kodira rRNA , in kot taka edina vrsta polimeraze, ki uporablja promotor RNA. Veže se na del promotorskega kompleksa, ki je sestavljen iz faktorja IA, povezanega s proteinom TBP, nato pa se lahko veže na zaporedje DNA navzdol od promotorskega kompleksa, ki kodira rRNA. Prek tega promotorja lahko RNA polimeraza I najde potrebna zaporedja DNK za prepisovanje veliko hitreje, kot če bi morala te sekvence najti sama, zato je ta promotor sredstvo za uravnavanje hitrosti transkripcije rRNA.