Razgradnja RNA je uničenje nekaterih posameznih odrezkov in verig RNA v celici. To igra pomembno vlogo pri uravnavanju celičnih procesov. V vsakem trenutku lahko celice v organizmu vsebujejo spremenljive količine RNA, vzorec tkiva pa je lahko podvržen razgradnji tako v skladiščenju kot v telesu. Ko se takšni vzorci uporabljajo za raziskave in profiliranje, lahko degradacija postane problem.
Celice uporabljajo RNA za signalizacijo začetka in konca različnih procesov. Celice proizvedejo veliko več RNK, kot jih vsebujejo, kar je bil prvi znak za raziskovalce, da se mora razgradnja RNA zgoditi v telesu, saj je genetski material moral nekam iti. Proces so od takrat preučevali pri različnih organizmih, zlasti pri bakterijah, saj so zelo primerni za znanstvene raziskave.
Pri razgradnji RNA se encimi zaklenejo na verigo in jo cepijo. Zaradi tega je sporočilo neuporabno, saj so se osnovni pari razpadli in ne ustvarjajo več celotne verige informacij. Encimi, ki so odgovorni za razgradnjo RNA, lahko tudi usmerjajo celico k recikliranju komponent, tako da se lahko ponovno uporabijo za izdelavo več RNA ali drugih spojin. Na različnih točkah življenjskega cikla celice morda potrebuje več ali manj signalov RNA za uravnavanje različnih procesov. Razgradnja RNA omogoča celicam, da ustvarijo, kar potrebujejo, in to zavržejo, če tega ne storijo s samoregulacijo.
Nekatere verige RNA imajo zelo kratko življenjsko dobo, druge pa lahko živijo dlje, ker so del zapletenih in tekočih procesov. Raziskovalci si lahko ogledajo različne vrste kompleksov RNA, da bi izvedeli več o tem, kako delujejo v telesu in kdaj se začnejo razpadati. Postopek se običajno začne na enem od koncev pramena, podobno kot pri razpletu šala. Encimi, ki so odgovorni za cepljenje RNA, se lahko zaklenejo na določene baze ali pare in začnejo svoje delo, da sesekljajo verigo na krajše segmente.
Tako kot DNK, RNA nosi ogromno informacij in deluje kot signalizator v telesu. Niso vsi DNK in RNA v celici aktivni hkrati, saj bi to povzročilo zmedo in zmešnjavo dogodkov v celici; na primer, jetrna celica bi poskušala delovati tudi kot kožna celica, mišična celica itd., ker bi bili aktivni vsi geni, vključeni v celično diferenciacijo. Vsaka celica ima načrt, ki ga uporablja, da določi, kakšna celica bo in vrste funkcij, ki jih bo izvajala, vse do razgradnje RNA, da se znebi RNA, ki je ne potrebuje več.