Rastlinski patogen je organizem, ki povzroča bolezni in napada rastline. Rastlinski patogeni so zanimivi iz več razlogov, od skrbi glede krhkih ekosistemov do želje po zaščiti oskrbe s hrano. Obstajajo številne vrste patogenov, ki lahko ciljajo na rastline, vključno z virusi, bakterijami, protozoji, paraziti, črvi in arhejami. Ljudje, ki preučujejo rastlinske patogene, so znani kot fitopatologi ali rastlinski patologi.
Rastlinski patogeni lahko napadajo na več različnih načinov. Nekateri kolonizirajo tkivo v rastlini, drugi se naselijo na površini rastline, tretji pa lahko posežejo po določenih področjih, kot so korenine, stebla in listi. Patogeni običajno povzročajo težave, kot so odmrtje tkiva, porjavenje, zmanjšanje plodnosti, težave z nastavitvijo cvetov itd. V skrajnih primerih lahko ubijejo gostiteljsko rastlino.
Tako kot patogeni, ki napadajo ljudi, so tudi rastlinski patogeni zelo raznoliki. Rastlinski patogen se je morda razvil, da bi napadel določen rod ali vrsto rastlin ali širše okužil večino rastlin. Nekateri rastlinski patogeni izkoriščajo posebne biološke procese, ki se lahko pojavijo v gostiteljskih vrstah, drugi pa se zadovoljijo z uporabo rastlin kot doma, ker imajo dragocene vire, kot so hranila.
V kmetijstvu rastlinski patogeni vsako leto povzročijo resno škodo. Ko rastlino napade rastlinski patogen, njenih proizvodov običajno ni mogoče prodati. Naložba v rastlino je zaradi patogena neuporabna in običajno so veliki stroški vključeni v izkoreninjenje patogenov s polja in obravnavo drugih posledic okužbe. V nekaterih primerih polje postane tako obolelo, da ga je treba pustiti več let v prahi, da si opomore, preden se na njem znova poskusi gojiti pridelke.
Rastlinski patogen je lahko zaskrbljujoč tudi, če je po nesreči uvožen ali namerno vnešen v ranljiv ekosistem. Nekatere otoške države so za to še posebej zaskrbljene, saj imajo edinstveno floro, ki bi jo lahko uničil vneseni patogen s celine. Patogeni so lahko težava tudi, ko se širijo med okoliši; na primer, patogen, ki napada grozdje in je omejen na Evropo, lahko predstavlja veliko grožnjo, če doseže kleti v Avstraliji, ki morda ni pripravljena za obvladovanje patogena.
Ekologi se zanimajo za preučevanje patogenov, ki lahko okužijo rastline, pri čemer preučujejo njihove učinke na različne vrste in ekosisteme. Ko rastline doživijo odmiranje in druge težave, je pogosto vzrok rastlinski patogen, zato se lahko pokliče patolog, da ugotovi, kateri patogen je odgovoren, in razvije načrt za njegovo obvladovanje.