Rastlinski genom je zaporedje DNK, ki daje informacije za življenje rastline. V vseh živih organizmih je genom sestavljen iz genetskega materiala za ta organizem. Molekule DNK so združene v gene, ki zagotavljajo navodila, ki določajo, kaj rastlina počne, njeno barvo, obliko in velikost, kje in kako raste itd. Vsak živi organizem ima genom, ki je sestavljen iz vseh njegovih genov, ki določajo kaj je ta organizem.
Vsak genom, vključno z genomom rastline, je sestavljen iz niza nukleotidov, ki tvorijo DNK tega organizma. V DNK najdemo štiri vrste nukleotidov, ki so alanin (A), timin (T), gvanin (G) in citozin (C). Niz nukleotidov je lahko zelo dolg in njihov vrstni red je tisto, kar sestavlja gene. Namesto ene dolge verige DNK so geni združeni na kromosomih, ki se nahajajo v jedru vsake celice organizma. Različne vrste organizmov imajo poleg različnih genov tudi različno število kromosomov.
Preučevanje genomov znanstveniki izvajajo že vrsto let. Genetiki so poskušali najti gene, ki kodirajo določene lastnosti in funkcije živih bitij. Do nedavnega so bili omejeni v tem, kar lahko najdejo, zdaj pa so razvili metode oziroma iskanje celotnega zaporedja nukleotidov, ki sestavljajo genom. Za sekvenciranje rastlinskega genoma mora znanstvenik določiti vsak nukleotid, ki ga najdemo v vsakem kromosomu rastline, ki jo preučujejo.
Določanje zaporedij rastlinskih genomov ni bilo enostavno zaradi širokega nabora rastlin, pa tudi velike razlike v njihovih genomih. Razpon velikosti rastlinskega genoma se razlikuje od vrst, ki imajo genome, ki so tako majhni kot genomi majhnih živali, do drugih rastlin, ki imajo genome, ki so skoraj štiridesetkrat večji od človeškega genoma. Prvi rastlinski genom, ki je bil popolnoma sekvenciran, je bila rastlina Arabidopsis, ki je majhna rastlina kreše, ki je del družine gorčice. Ta rastlina je bila izbrana, ker ima v primerjavi z drugimi rastlinami relativno kratek genom. Zaporedje genoma Arabidopsis je pokazalo, da ima 25,000 genov, ki se zdaj uporabljajo za pomoč pri določanju genomskega zaporedja rastlin, ki imajo veliko daljše in veliko bolj zapletene genome.