Anatomija rastlin je študij fizične strukture rastlin. Znana je tudi kot fitoanatomija, pri čemer je praktik te znanstvene discipline znan kot fitoanatom. Tako kot pri živalski anatomiji je cilj izvedeti več o tem, kako so organizmi sestavljeni in kako delujejo, pri čemer se te informacije uporabijo za pridobivanje globljega znanja o tem, kako skrbeti za rastline in kako obravnavati bolezni, ki jih prizadenejo. Fitoanatomi delajo v številnih okoljih, vključno z naravoslovnimi muzeji, arboretumi in laboratoriji, ki razvijajo nove rastline za kmetijstvo in urejanje krajine.
Fitoanatomi preučujejo strukturo rastlin kot celote in jih secirajo, da bi spoznali njihove sestavne dele. Poteka lahko tudi na mikroskopski ravni, pri čemer anatom pregleda rastlinske celice, da bi izvedel več o njihovi funkciji in razlikoval med različnimi vrstami rastlinskih celic. Rastlinske anatome zanima tudi razvoj rastlin, od njihovih najzgodnejših stopenj kot semena do njihove zrelosti do zrelosti.
Z seciranjem in preučevanjem rastlin lahko raziskovalci spoznajo razlike med različnimi rastlinami, kar je pomemben del rastlinske taksonomije. Dve rastlini sta lahko na primer na površini videti zelo podobni, vendar sta si korenito različni, če ju razčlenimo in pogledamo pod mikroskopom. Te razlike je mogoče uporabiti za opis in kategorizacijo rastlin, tako da jih je mogoče umestiti v taksonomski sistem. Anatomija rastlin lahko vključuje tudi natančno preučevanje na novo odkritih rastlin, da se potrdi, da so edinstvene, in da se o njih zberejo podatki, ki jih je mogoče uporabiti za njihovo kategorizacijo.
Ljudje vse bolj ločujejo anatomijo in morfologijo rastlin, pri čemer se anatomija ukvarja z notranjo strukturo rastlin, medtem ko morfologija vključuje zunanji videz rastline. Vendar pa obstaja nekaj prekrivanj med polji. Cvet, na primer, lahko pregledata morfolog in anatom, pri čemer se oba zanimata za zunanjo in notranjo strukturo rože, da bi izvedeli več o njej.
Ljudje, ki delajo kot rastlinski anatomi, običajno obiskujejo visokošolske tečaje iz botanike, biologije in sorodnih tem. Lahko se odločijo, da se bodo osredotočili na določene vrste rastlin, kot so tropske rastline, živilske rastline itd., ali pa lahko delajo kot splošni anatomi v objektih, kot so naravoslovni muzeji, katalogizirajo nove pridobitve in upravljajo obstoječe zbirke, tako da jih je mogoče enostavno obiskovalci navigirajo in uporabljajo kot vir. Delujejo lahko tudi na mestih, kot so laboratoriji za farmacevtske raziskave, kjer preučujejo rastline z zdravilnimi lastnostmi.