Rafinerija je tovarna ali predelovalni obrat, kjer se surovi ali osnovni materiali predelajo v bolj uporabne oblike. Obstaja veliko različnih vrst rafinerij, ki lahko proizvajajo vse vrste izdelkov, od nafte do kuhinjske soli. Rafinerije pogosto vsebujejo zapletene mehanske sisteme, ki omogočajo varno in pravilno pretvorbo iz surovin v končne izdelke.
Verjetno najbolj poznana vrsta rafinerije je rafinerija nafte, kjer je surovo nafto izpostavljeno kemičnim in mehanskim procesom, da jo spremenijo v bolj uporabne oblike. Bencin, kerozin in naftni derivati se lahko proizvajajo v rafineriji nafte. Te rafinerije imajo neverjeten gospodarski in strateški pomen za številne regije; v vojni so rafinerije nafte pogosto prva tarča, saj lahko upočasnijo ali ustavijo infrastrukturo druge strani. Ker velik del svetovne tehnologije trenutno deluje na fosilna goriva, ki jih predelujejo rafinerije, sta varnost in učinkovitost teh predelovalnih obratov zelo zaskrbljujoči po vsem svetu.
Številne najstarejše tehnike rafiniranja na svetu se uporabljajo za predelavo surove hrane v končne izdelke. Rafinerije sladkorja obstajajo že stoletja in spreminjajo peso in trs v številne oblike sladkorja, ki se uporabljajo v vsakdanji kuhinji. V sodobni rafineriji sladkorja so surovine prečiščene, nasičene in končno posušene v pravilni koncentraciji za pošiljanje v pakiranje.
Pomemben dejavnik pri pregledu rafinerij je proizvodnja stranskih proizvodov. To so ločene spojine, nastale med postopkom rafiniranja, ki imajo lahko lastno uporabo. Melasa je na primer stranski proizvod rafinerij sladkorja. Žveplo in žveplova kislina sta včasih stranski produkt rafiniranja nafte.
Varnost je glavna skrb pri skoraj vseh operacijah rafinerije. Rafinerije nafte in plina imajo ogromno požarno in eksplozivno nevarnost, saj so materiali po naravi vnetljivi. Poleg tega so delavci pogosto v nevarnosti, da bodo izpostavljeni onesnaževalom in jedkim kemikalijam ter hlapom, ki lahko povzročijo kronične ali celo smrtne poškodbe. Žal imajo rafinerije dolgo zgodovino nesreč in smrti zaradi nadzora in celo namernega zmanjšanja varnostnih ukrepov. Številne vladne agencije in sindikati menijo, da so strogi varnostni standardi rafinerije glavna prednostna naloga v industriji.
Onesnaževanje je še ena velika skrb pri delovanju rafinerij. Kemični procesi in velika količina energije, potrebne za delovanje velike rafinerije, lahko prispevajo k emisijam toplogrednih plinov in povečanemu onesnaženju zraka, vode in tal. Ker globalno segrevanje postaja glavna skrb v 21. stoletju, aktivisti in nekatere okoljsko ozaveščene rafinerije iščejo načine za zmanjšanje onesnaževanja in vključitev zelene tehnologije, kot je alternativna energija, v rafinerije.