Protivirusna programska oprema USB je vrsta programske opreme za zaščito pred virusi, ki pomaga zmanjšati možnost zlonamernih napadov na sisteme z uporabo neke vrste zunanjega pogona ali naprave. Programska oprema te vrste pomaga prepoznati in blokirati grožnje, ki se lahko pojavijo z okuženimi datotekami, ki jih najdemo na pogonu za skok ali na zunanjem trdem disku. Če je okuženo napravo mogoče povezati z računalnikom z uporabo univerzalnega serijskega vodila ali kabla USB, bo programska oprema zaznala okužbo in sprejela ukrepe za njeno zajezitev.
Dejanska funkcija protivirusne programske opreme USB je podobna zaščiti, ki jo ponujajo programi za zaščito pred virusi, ki spremljajo dejavnost na trdem disku. Če je programska oprema pravilno nameščena, se bo programska oprema aktivirala vsakič, ko bo oddaljena naprava, kot je jump ali Pen drive, ali zunanji trdi disk priključena na sistem prek vrat USB. Programska oprema običajno deluje v ozadju, ko je povezava vzpostavljena, pri čemer analizira vse datoteke, najdene na zunanji napravi. Če se na zunanji napravi odkrijejo računalniški virusi ali druge grožnje, kot je vohunska programska oprema, bo programska oprema preprečila, da bi se zlonamerna programska oprema vnesla v sistem in morda okužila trdi disk.
Odvisno od konfiguracije protivirusne programske opreme USB lahko program samodejno vsebuje domnevne grožnje in uporabniku omogoči, da jih pregleda, preden jih trajno odstrani. Ta pristop pogosto zahteva karanteno okuženih datotek in domnevnih virusov med zaščitnim pregledom, nato pa uporabniku omogoči, da pregleda vsako domnevno okužbo. Od tam se lahko uporabnik odloči, da prezre domnevno grožnjo in uporabi datoteke, ali pa da programska oprema očisti datoteke in odstrani grožnje. Drugi protivirusni programi USB so nastavljeni tako, da samodejno posodabljajo in iščejo grožnje ter jih odstranijo, ko jih najdemo.
Kot pri vseh vrstah zaščite pred virusi je pomembno, da protivirusno programsko opremo USB posodabljate. Večina programov omogoča samodejno nalaganje posodobitev, ko je program aktiviran. Številne programe je mogoče konfigurirati tako, da iščejo posodobitve na ponavljajoči se osnovi, na primer vsak dan ob določenem času dneva. Poleg plačljivih programov, ki zagotavljajo širši nabor zaščite, je mogoče prenesti tudi brezplačno protivirusno programsko opremo USB, ki bo zagotovila osnovno zaščito za rezidenčne uporabnike, ki redno uporabljajo pogone za pisala in zunanje pogone ter celo prenašajo datoteke iz naprav, kot je npr. digitalnih fotoaparatov z uporabo kabla USB in vrat.