Pomanjkanje molibdena je zelo redko in se pojavi, ko telesu primanjkuje ali ne more razgraditi minerala molibdena. To je mineral, ki pomaga pri razstrupljanju jeter. Deluje tudi kot kofaktor v številnih encimih, ki so bistveni za delovanje človeškega telesa. Potrebe telesa po molibdenu so relativno nizke v primerjavi z drugimi minerali, ki jih potrebuje, in pomanjkanje molibdena se običajno ne pojavi v naravnih okoljih.
Večina primerov pomanjkanja molibdena se pojavi pri tistih, ki so bili rojeni brez encima, ki je potreben za razgradnjo minerala, kar ima za posledico zelo redke recesivne motnje presnove. Obstaja le en dobro dokumentiran primer pridobljenega pomanjkanja molibdena. Bolnik je dobil hiter srčni in dihalni utrip, nočno slepoto in sčasoma postal komatozen.
Potrebe po molibdenu so pri ljudeh razmeroma nizke. Poleg tega lahko molibden zlahka pridobimo s prehrano fižola, temno zelene listnate zelenjave in nekaterih žit. Pravzaprav pomanjkanja molibdena pri popolnoma zdravem bolniku še nikoli niso opazili. Tisti z največjim tveganjem za razvoj so bolniki, ki se hranijo intravensko. Za tiste, ki trpijo zaradi pomanjkanja molibdena, lahko sprememba prehrane ali jemanje dodatkov molibdena stanje obrne.
Čeprav sta oba povezana, se pomanjkanja molibdena ne sme zamenjevati s pomanjkanjem molibdenovega kofaktorja. Pomanjkanje molibdenovega kofaktorja je redka presnovna motnja, pri kateri telesu primanjkuje encima ksantin dehidrogenaze, encima aldehid oksidaze in encima sulfit oksidaze. Vsi ti encimi so potrebni za presnovo ksantina, baze, ki se spremeni v sečno kislino, potrebno za zdravo delovanje možganov. Pomanjkanje molibdenskega kofaktorja lahko povzroči hude nevrološke simptome, vključno s krči in komo.
Molibden kot mineral ima številne prednosti za človeško telo. Je bistvenega pomena za delovanje jeter, saj pomaga jetrom pri filtriranju telesne krvi. Molibden uravnava presnovo kalcija, magnezija in bakra. Prav tako olajša porabo železa v telesu, ki je potrebno za normalno rast in razvoj. Molibden je bil povezan z rastjo kosti in zmanjšanim tveganjem za zobno gnilobo. Nekatere študije celo povezujejo ta mineral z majhnim tveganjem za raka na želodcu in požiralniku.
Preveč molibdena je lahko škodljivo tudi za telo. Velika količina molibdena lahko povzroči, da telo uporablja baker ali spremeni aktivnost alkalne fosfataze. Nekateri neželeni učinki prevelike količine molibdena so driska, anemija in otekanje sklepov. Preveč molibdena sicer ni dobro za telo, je prav tako redko kot pomanjkanje molibdena, saj telo hitro izloči mineral, če ga zaužijemo v velikih količinah.