Fagoterapija je možnost zdravljenja bakterijskih okužb, ki vključuje vnos organizmov, znanih kot bakteriofagi, v telo. Ti organizmi ubijejo bakterije in rešijo okužbo. To zdravljenje velja za eksperimentalno v mnogih regijah sveta, čeprav si raziskovalci prizadevajo izvedeti več o njem in pokazati možne uporabe in omejitve terapije s fagi.
Ta tehnika je bila razvita v Rusiji in je najbolj sprejeta v medicinski skupnosti v Rusiji in nekaterih nekdanjih članicah Sovjetske zveze, kot je Gruzija. Dokumentirana uporaba fagoterapije sega v prvo svetovno vojno, ko so to tehniko uporabljali za zdravljenje vojakov. Okužbe zaradi bojnih ran in slabe razmere v jarkih so bile velik problem za številne narode, ki so se borili v vojni, in terapija s fagi je bila ena izmed mnogih tehnik, razvitih med to vojno, da bi zmanjšali umrljivost vojakov.
Terapija s fagi ima nekaj izrazitih prednosti. Za razliko od antibiotikov, ki imajo bolj splošen učinek, so fagi usmerjeni posebej na ozek nabor bakterijskih vrst. Ne povzročajo kolateralne škode koristnim bakterijam v telesu in zdravim celicam, posledično pa zdravljenje s fagi ni povezano s stranskimi učinki. Fage je mogoče uporabiti tudi za zdravljenje bakterij, ki so odporne na antibiotike, in čeprav lahko bakterije razvijejo odpornost na fage, je enostavno razviti nove fage za kompenzacijo, v nasprotju z dolgim razvojnim obdobjem za nove antibiotike.
Glavna pomanjkljivost fagne terapije je njena zelo ozka uporaba. Pri bolnikih z bakterijskimi okužbami je treba vzorce od pacienta gojiti in nato testirati z več potencialnimi bakteriofagi, da ugotovimo, kateri bo najučinkoviteje omejil bakterije. Zaradi tega je lahko fagoterapija draga in dolgotrajna, v nasprotju z antibiotično terapijo, pri kateri se zdravila pogosto dajejo ob prvih znakih okužbe, da začnejo bakterije takoj uničiti.
Da bi bilo zdravljenje s fagi odobreno za uporabo na lokacijah, kot so Združene države in Evropa, bo treba obsežno testirati glede varnosti in učinkovitosti ter podvrgnuti postopku pregleda zdravil, ki se uporablja za ocenjevanje drugih zdravil. Ta proces lahko traja leta, včasih pa tudi desetletja, saj so varnostna vprašanja najpomembnejša. Za to se zanima več raziskovalnih institucij, ki so začele s pilotnimi programi majhnega obsega, s porastom bakterij, odpornih na antibiotike, pa se lahko velike biološke raziskovalne organizacije in farmacevtska podjetja pridružijo raziskovalni skupnosti za fagoterapijo.