V medicini je patogeneza bolezni izraz, ki se uporablja za označevanje nastanka in razvoja bolezni. Študija patogeneze bolezni, ki jo pogosteje imenujemo preprosto patogeneza, je podvejo širših področij patobiologije in patologije. Medtem ko se patobiologija in patologija nanašata na splošno biologijo, razvoj in napredek bolezni, se patogeneza običajno osredotoča na dejavnike, ki vodijo do začetnega izvora bolezni.
V primeru številnih bolezni na patogenezo bolezni vpliva več dejavnikov. Posameznik ima lahko na primer genetsko nagnjenost k bolezni, vendar se bolezen dejansko ne pojavi, razen če so prisotni tudi določeni okoljski dejavniki. Podobno se okuženi posameznik pogosto bori proti nekaterim vrstam nalezljivih bolezni brez kakršnih koli simptomov. Takšne okužbe lahko povzročijo bolezen na primer le, če je prisotna bakterija ali virus, ki jo povzroča, hkrati pa je imuniteta okužene osebe oslabljena zaradi podhranjenosti ali motnje imunskega sistema.
Obstaja veliko različnih vrst patogeneze bolezni. Ti vključujejo vdor virusov ali bakterij v telo, vnetja kot odziv na kemikalije, fizične travme, prisotnost rakavih celic in številne različne vrste genetskih motenj. Ker obstaja toliko možnih izvorov bolezni, so zdravniki in raziskovalci, ki preučujejo patogenezo bolezni, pogosto specializirani za eno določeno področje patogeneze.
Nekatera specializirana področja patogeneze vključujejo hematopatologijo, klinično mikrobiologijo, genetiko in imunopatologijo. Hematopatologija se nanaša na nenormalnosti krvi, kostnega mozga in limfnega sistema ter na to, kako lahko takšne nepravilnosti vodijo do bolezni. V klinični mikrobiologiji študij patogeneze vključuje preučevanje, kako se bakterije in virusi širijo in razmnožujejo. Genetika ima zelo pomemben vpliv na patogenezo, saj veliko število bolezni nastane delno ali v celoti kot posledica določenega gena, mutacije ali nenormalnosti v genetskem materialu bolnika. Imunopatologija je še posebej pomembna pri patogenezi bolezni nalezljivih bolezni, saj se nanaša na imunski sistem, vključno s tem, kako lahko oslabelost imunskega sistema omogoči, da se virus ali bakterija prevzame in povzroči bolezen.
Medtem ko so nekateri zdravniki specializirani za eno od zgornjih področij patogeneze, lahko drugi zdravniki in raziskovalci delajo na več področjih. To je pogosto pri posameznikih, ki preučujejo patogenezo, saj se nanaša na določeno bolezen. V primeru nekaterih vrst raka lahko razumevanje celotne patogeneze bolezni vključuje genetske, infekcijske, kemične in imunološke dejavnike.