Ohranjanje netopirjev je izraz, ki opisuje prizadevanja zadevnih posameznikov za pomoč pri krepitvi ogroženih populacij netopirjev po vsem svetu. Po mnenju strokovnjakov so bili netopirji ogroženi zaradi številnih razlogov, vključno z uničenjem habitata, uporabo pesticidov in bolezni. Da bi zaščitili netopirje, so ljudje naredili vse od sprejemanja zakonov za zaščito njihovih habitatov, do raziskovanja groženj za populacijo netopirjev do poučevanja ljudi o netopirjih, da bi pridobili javno podporo za ohranjanje.
Po svetu obstaja veliko različnih vrst netopirjev in mnogi od njih imajo popolnoma drugačno prehrano, kar ima za posledico zelo različne vloge v ekosistemih. Mnogi netopirji na primer služijo predvsem kot plenilci žuželk, drugi pa lahko jedo sadje, služijo ekosistemu s širjenjem semen in ohranjajo zdrave gozdove. Strokovnjaki v večini primerov menijo, da veliko teh vlog ne morejo nujno izpolniti druge živali, če bi netopirji izumrli, nekateri strokovnjaki pa menijo, da so možne posledice takšnega pojava lahko izjemno hude. Zaskrbljenost zaradi teh nevarnosti je ena glavnih gonilnih sil številnih prizadevanj za ohranjanje netopirjev.
Nekateri netopirji živijo na drevesih, drugi pa v jamah, največja grožnja netopirjem pa je na splošno uničenje habitata. Včasih uničenje habitata netopirje prizadene neposredno, tako da uniči kraje, kjer živijo, v drugih primerih pa je lahko bolj posredno. Na primer, ko ljudje uničijo močvirja in druga območja, kjer se žuželke razmnožujejo v velikem številu, lahko zmanjšanje populacije žuželk povzroči pomanjkanje hrane za netopirje. Druga težava je, da nekateri jamski netopirji živijo tudi v starih stavbah, in ko te zgradbe porušijo, netopirji izgubijo svoje domove. Na nekaterih območjih so bili sprejeti celo zakoni o ohranjanju netopirjev, ki omejujejo uničenje vseh zgradb, ki jih netopirji uporabljajo kot zavetje, nekateri ljudje pa so na svojih osebnih posestvih postavili majhna zavetišča za netopirje, da bi nadomestili te izgube habitata.
Druga velika nevarnost za netopirje je glivična okužba, znana kot sindrom belega nosu, in veliko prizadevanj za ohranjanje netopirjev je namenjenih boljšemu razumevanju bolezni. Sindrom belega nosu vodi do rasti gliv na različnih delih telesa, vključno z usti, in lahko povzroči, da netopirji zapustijo svoja gnezda med sezono hibernacije, kar na koncu privede do stradanja in smrti. Nekateri strokovnjaki menijo, da so za hitro širjenje te glive lahko v prvi vrsti odgovorni človeški jamarji, čeprav to ni nujno gotovo. Nekateri strokovnjaki so predlagali, da bi se morali ljudje izogibati jamam, dokler bolezen ni bolje razumljena, drugi pa so preprosto pozvali ljudi, naj nikoli ne nosijo istih oblačil v dveh različnih jamah.