Odpornost na klindamicin se nanaša na sev bakterij, ki ga je klindamicin nekoč ubil, vendar je razvil imunost proti zdravilu. Bakterija je živ organizem, ki se lahko prilagodi svojemu okolju za preživetje. Antibiotska terapija uniči ranljive bakterije, vendar močnejši bakterijski sevi ostanejo in razvijejo načine za upiranje toksičnim učinkom antibiotika klindamicina. Ko se bakterije razmnožujejo in prenašajo prilagodljive moči na svoje potomce, populacija bakterij razvije široko odpornost na zdravilo. Sposobnost bakterij, da se prilagodijo in se uprejo učinkom klindamicina, se imenuje rezistenca na klindamicin.
Antibiotično zdravilo, klindamicin, je bilo razvito za boj proti pogostim okužbam, ki jih povzročajo anaerobne bakterije, kot so malarija, kožne okužbe, toksoplazmoza, peritonitis, okužbe dihalnih poti in zobne okužbe. Te bolezni so večinoma okužbe, pridobljene v skupnosti, in so zato prisotne v zelo velikem številu v zelo širokem razponu okolij. V tako velikem okolju se lahko bakterije, ki povzročajo te okužbe, prilagodijo in prilagodijo. Odvisno od vrste bakterije in njenega načina prilagajanja lahko bakterije nevtralizirajo učinke klindamicina ali se hitreje razmnožujejo, tako da preseže učinkovitost zdravila.
Problem odpornosti na antibiotike, vključno z odpornostjo na klindamicin, je postal svetovno zdravstveno vprašanje. Bolezni, ki so bile enkrat premagane z antibiotično terapijo, se povečujejo v številu in se neovirano širijo po svetovni populaciji ali z dragimi in težkimi alternativami zdravljenja. Okužba s staphylococcus aureus (MSRA), odporna na meticilin, ali “superbug”, kot jo pogosto imenujejo, je nevaren primer odpornosti na klindamicin. Ta pogosta, nalezljiva okužba kože se lahko razvije v zelo hudo bolezen, ki uničuje meso ali usodno. Edino zdravljenje nekaterih okužb z MSRA je odstranitev obolelega dela telesa ali amputacija prizadetega uda.
Da bi preprečili strašne učinke odpornosti na klindamicin, zdravstveni delavci svetujejo zadržanost pri uporabi antibiotikov in pravilno dajanje zdravil z antibiotično terapijo. Klindamicin ni primeren za virusne okužbe, kot so prehlad, gripa, bronhitis in številna vnetja ušes. Antibiotik je treba dajati samo za sev bakterij, na katerega vpliva. Bolniki morajo opraviti celoten predpisani odmerek, da v celoti uničijo vse seve bakterij v telesu.