Nanobakterije, znane tudi kot nanobakterije, so mikrobi, veliki okoli 25-200 nanometrov, približno 10-krat manjši od tistih, ki se na splošno štejejo za izjemno majhne bakterije. Nanobakterije so sporne, ker so se trditve o njihovem obstoju pojavile šele pred kratkim – leta 1990 – in so manjše od tistega, kar se na splošno šteje za spodnjo mejo velikosti za živo celico (200 nm). Alternativno so jih opisali kot nežive kristalne izrastke in najbolj razširjeno obliko življenja na Zemlji.
Prve nanobakterije je v mineralih odkril Bob Folk, ki je v SEM študiji karbonatov vročih izvirov z veliko povečavo odkril majhne sferoidne in ovalne predmete v kalcitu in aragonitu v velikosti 25-200 nm. Ker so bile po obliki podobne večjim bakterijam, vendar veliko manjše, jih je Folk imenoval nanobakterije. Od takrat obstajajo trditve o najdbah v različnih mineralih, človeški in živalski krvi ter celo v marsovskem meteoritu ALH84001, odkritem leta 1996 na Antarktiki.
Čeprav so obstoj nanobakterij izpodbijale tako geološke kot mikrobiološke skupnosti, so številni uveljavljeni raziskovalci objavili prispevke o nanobakterijah in njihovih domnevnih učinkih. Eden od teh učinkov je menda kalcifikacija krvi v naših arterijah. Fosil nanobakterije, kot se imenuje nanofosil.
Študije nanobakterij so bile zahtevne. Ker so tako majhne, je bilo težko izvleči genski material iz teh entitet, kar pomeni, da še vedno ni prepričljivih dokazov, da so življenjske oblike. Prav tako je bilo navedeno, da tako imenovane nanobakterije spominjajo na nežive strukture, za katere je znano, da nastanejo, ko se kalcijeve in fosfatne soli združijo z organskim materialom.
Leta 1998 so finski znanstveniki poročali o izolaciji RNA iz vzorca nanobakterij, vendar se je izkazalo, da je ta študija napačna, ko je Nacionalni inštitut za zdravje ugotovil, da je RNA pridobljena iz mikroba, za katerega je znano, da kontaminira laboratorijsko opremo. Zadeve še dodatno zaplete, trdijo, da niso bile razveljavljene vse finske ugotovitve, kar je pustilo odprt prostor za nadaljnje raziskave in testiranje. Tudi leta 1998 so bile nanobakterije obtožene, da prispevajo k nekaterim boleznim, ko so jih opazili, da okoli sebe ustvarjajo lupine iz kalcijevega fosfata.
Živi organizem ali izrastki anorganskih kristalov? Pravi odgovor še ni jasen. Karkoli že so, so prekleto majhni.