Mikrobna patogeneza je proces, s katerim mikroorganizem povzroči bolezen. Mikroorganizmi, ki so sposobni mikrobne patogeneze, vključujejo bakterije, glive in viruse. Oblike teh organizmov, ki povzročajo bolezni, se imenujejo patogeni. Mikrobna patogeneza sledi izvoru in vzroku bolezni, kako se manifestira v telesu in kako se telo nanjo odzove.
V človeškem telesu obstajajo štiri glavne vrste patogeneze. Vnetje je otekanje tkiva v telesu, ko se težava obravnava in zamenja okuženo tkivo. Malignost je nenormalen razvoj celične reprodukcije, ki jo pogosto najdemo pri raku. Razpad ali nekroza tkiva je smrt celic zunaj normalnega celičnega cikla. Okužba se pojavi, ko celice okužijo bakterije, virusi glivnih spor.
Okužbe so najverjetnejša oblika mikrobne patogeneze, čeprav se lahko pojavijo vnetja kot stranski produkt okužbe. Vsako takšno okužbo lahko razdelimo v tri široke kategorije. Akutna okužba je relativno kratka, končna in s hitrim začetkom. Kronična okužba je dolgotrajna in se je težko spopasti. Ponavljajoča se okužba se lahko začne hitro ali počasi, vendar bo izginila, kot da bi bila ozdravljena, da bi se vrnila pozneje.
Vsaka okužba z mikrobno patogenezo poteka v treh širokih fazah. To so začetna okužba, razmnoževanje in nadaljevanje vrste. Zadnja dva sta glavna razloga za vsako okužbo. Mikroorganizem potrebuje večji organizem, kot je človek, da se lahko razmnožuje in širi. Množenje ali replikacija se pogosto zgodi znotraj celice.
Cilj mikroorganizma, ko se začne razmnoževati, je izločiti svoje različice iz telesa, preden ga telesne samoobrambne sile uničijo. Telo se običajno odzove z mešanico belih krvnih celic, imenovanih tudi makrofagi, in protiteles. Mikroorganizem bo zato poskušal priti iz telesa, da bi okužil nekoga, čigar imunski sistem ni pripravljen, da ga takoj odbije.
To pomeni, da sta začetna faza okužbe in končna faza prenosa neizbrisno povezani – obstajajo štirje glavni načini za prenos mikrobne patogeneze z ene osebe na drugo. Prvi je preko aerosolov, kot so vodne kapljice pri kašljanju in kihanju. Drugi je z zaužitjem ali s fekalnimi snovmi. Tretji se prenaša z vektorji, kot ga prenašajo druge živali, kot so komarji in klopi. Četrta glavna pot je preko izmenjave telesnih tekočin med seksom, transfuzije krvi in poljubljanja.
Uspeh okužbe je odvisen tudi od številnih dejavnikov. Eden od dejavnikov je narava mikroorganizma in način njegovega razmnoževanja. Drugi je imunski status okuženega posameznika. Če je bil posameznik že v stiku z mikroorganizmom, obstaja velika verjetnost, da bo telo dobro pripravljeno, da ga odbije.