Matrična metaloproteinaza 9 (MMP9) je encim, ki ga najdemo predvsem pri ljudeh in ga kodirajo geni matriksne metaloproteinaze (MMP). Človeški proteini in encimi iz družine MMP razgrajujejo celični material kot del normalnega preoblikovanja tkiva in drugih bioloških procesov. Encimi MMP prav tako prispevajo k napredovanju nekaterih bolezni z razgradnjo kolagena, razgradnjo zunajceličnih matriksov in pomoč pri metastazah. Raziskovalci verjamejo, da ima MMP9 pomembno vlogo pri metastazah nekaterih vrst raka, pa tudi pri razgradnji kolagena pri nekaterih vrstah artritisa.
Medtem ko je matriksna metaloproteinaza 9 naravno prisoten, produktiven encim, potreben za popravilo tkiva in druge procese, je najpogosteje povezana z napredovanjem raka. Natančneje, MMP9 razgradi bazalne membrane celic, kar daje tumorjem več prostora za rast. Rakave celice pomagajo usmerjati MMP9, da razgradi kolagen IV, kar omogoča, da se rak preseli, kar povzroči metastaze. Skratka, naravni namen takšnih encimov postane koristen za škodljive celice.
Za boljšo študijo raziskovalci združujejo gene MMP v štiri primarne kategorije na podlagi funkcije in namena vsakega gena ter beljakovin ali encimov, ki jih proizvaja. Te kategorije so kolagenaze, želatinaze, stromelizini in membranske vrste. Glede na matrično metaloproteinazo 9 ta encim sodi predvsem v kategorijo želatinaz MMP. Gen MMP9 ustreza tudi določenim vedenjskim in funkcionalnim kriterijem kolagenaz.
V znanstvenih raziskavah ima matriksna metaloproteinaza 9 tudi imena in klasifikacije, kot so želatinaza B, 92 kDa kolagenaza tipa IV in 92 kDa želatinaza. Dodatni imeni vključujejo kolagenazo tipa IV in kolagenazo tipa IV-B. Odbor za gensko nomenklaturo HUGO (HGNC) je matrični metaloproteinazi 9 dodelil simbol MMP9, da bi nadomestil prejšnji simbol CLG4B. Uradni simboli zagotavljajo doslednost med raziskovalci, ki delajo v različnih laboratorijih, državah in jezikih.
Če pogledamo človeške kromosome in DNK, najdemo gen matriksne metaloproteinaze 9 na kromosomu 20. Kot navaja HGNC, je natančna lokacija 20q12-q13. Takšne koordinate označujejo lokacijo gena na 20. kromosomu, v območju med q12 in q13. Posledično so raziskovalci odkrili razširitve na tem genetskem področju pri bolnikih z rakom dojk in jajčnikov. Druge študije povezujejo to genetsko področje s tumorji hipofize, psevdohipoparatiroidizmom in sladkorno boleznijo.
Strukturno gledano je MMP9 presenetljivo podoben MMP2, še en znanstvenik za gen MMP verjame, da pomaga pri metastazah raka. V smislu homologije ali podobnosti dveh struktur je aminokislinska zaporedja MMP9 in MMP2 taka, da sta oba običajno povezana z agresivno invazivnimi raki. Encima MMP9 in MMP2 razgrajujejo beljakovine zunajceličnega matriksa, pri čemer se pri raku trebušne slinavke, dojk in debelega črevesa in danke pojavi zelo povišana ekspresija obeh.