Kirurški poseg marsupializacije vključuje ustvarjanje trajnega izhoda v cisto. Hiter in razmeroma preprost postopek, pogosto zahteva le lokalno anestezijo. Postopek vključuje vrezano odprtino, ki je odprta s šivi. Zlasti ciste Bartholinovih žlez se običajno zdravijo z metodo marsupializacije.
Ciste se razvijejo v žlezah, če je normalen izstop tekočine iz žleze blokiran. To poveča velikost kanala in žleze, saj se tekočina, ki jo izloča žleza, kot je sebum, ujame in se kopiči za blokado. Postopek vključuje izdelavo novega, trajnega izhoda za tekočino.
Primer stanja, ki se pogosto zdravi z marsupilizacijo, je cista Bartholinove žleze v nožnici. Te žleze se nahajajo na obeh straneh notranjih ustnic vagine. Običajno jih ni mogoče občutiti, vendar lahko ciste žlez zrastejo do velikosti 3 cm (1.2 palca).
Najprej se naredi rez, ki prereže zunanjo kožo in notranjo steno ciste. To omogoča uhajanje notranje tekočine. Nato se od stene ciste in zgornje kože v ovalni obliki odreže rezina mesa.
Da preprečite, da bi se ureznina zacelila nazaj čez cisto in se ponovila, mora zdravnik narediti odprtino trajno. To dosežemo tako, da stranice reza prepognemo nazaj in jih prišijemo na okoliško kožo, da ustvarimo odprtino za žlezo. Če zdravnik eno od teh cist preprosto zabode tako, da naredi rez, ki ni odprt, se lahko cista ponovi.
Pri marsupilizaciji se cista običajno ne zapre. Šivi na straneh reza so lahko izdelani iz biološko vpojnega materiala, ki ga ni treba odstraniti. Ko čas mineva in se rez zaceli, postanejo stranice rane manjše in tesnejše.
Ta oblika operacije običajno zahteva samo lokalno anestezijo na območju namesto splošne anestezije. V primeru ciste Bartholinove žleze jo lahko zdravnik opravi v ambulanti splošne medicine, celoten poseg pa traja le približno 15 minut. Bolnišnice lahko izvajajo tudi postopke marsupializacije. Ta oblika zdravljenja ciste je lahko prva izvedena ali pa se uporablja kot sekundarno zdravljenje, kjer druge tehnike niso delovale učinkovito. Podoben postopek, ki se imenuje operacija okna, je novejša tehnika kot marsupializacija, ki vključuje večji rez z manjšim tveganjem, da bi bil oviran.