Ločeni sistem je oblika oblikovanja in filozofije zapora, ki si prizadeva izboljšati reformni proces zapornikov z izolacijo in pomanjkanjem družbene interakcije. Ta sistem se je uporabljal predvsem pri gradnji številnih zaporov, v katerih naj bi bil vsak zapornik zaprt v ločeni enoti, s čimer je bil vsak zapornik dejansko nameščen v samico. Izolacija je bila dodatno okrepljena s številnimi metodami, s katerimi so zaporniku odvzeli prejšnjo identiteto. Ta ločen sistem je bil mišljen kot način za zagotovitev, da kriminalne subkulture in stališča ne bi mogli cveteti v zaporih.
Zaradi uporabe ločenega sistema v vzhodni državni kaznilnici blizu Philadelphie v Pensilvaniji je bil ta sistem pogosto vključen v zasnovo zapora, imenovan tudi “sistem Pennsylvania”. Zapor, zgrajen z uporabo ločenega sistema, bi običajno izgledal podobno kot del kolesa, ki bi ga lahko uporabljali na kolesu ali kočiji. Tam bi bila centralna pisarna, ki bi delovala kot središče zapornikov in upravnikov, iz tega vozlišča pa bi se raztezala vrsta kril kot napere na kolesu. V vsakem od teh kril so bile posamezne celice, v katerih so bili zaporniki zaprti sami.
Ločen sistem je bil zasnovan tako, da zmanjša interakcijo med zaporniki kot način za preprečevanje nastajanja kriminalnih združb v komunalnih zaporniških okoljih. Ta zasnova naj bi tudi pospešila reformacijo zapornikov, tako da je vsakega zapornika izoliralo in mu dalo čas, da razmisli o tem, kaj je storil. Za nadaljnje doseganje teh ciljev so bili zaporniki v zaporu ločenega sistema omenjani le po številki, nikoli po imenu, in jim ni bil dovoljen skoraj noben stik z drugimi zaporniki. Tudi zunaj celic so med vajami pogosto telovadili na posameznih območjih, ki so zapornike držala drug od drugega.
Ti posamezni prostori za vadbo niso bili vedno praktični in toliko zaporov, ki so uporabljali ločen sistem, bi zapornikom omogočilo, da telovadijo skupaj s kapucami, ki so pokrivale njihove obraze. Zaporniki so bili pogosto pritrjeni na vrv, ki je vsakega zapornika ločevala drug od drugega, in od njih se je pričakovalo, da bodo med vadbo molčali. Tudi med verskimi bogoslužji so zaporniki smeli vokalizirati samo s petjem in so sedeli v kabinah, ki so kaplanu omogočale, da jih vidi, vendar se niso mogli videti. Ločen sistem je vplival na zasnovo številnih sodobnih zaporov, čeprav je zaradi povečanega števila zapornikov nenehno izolacija nepraktična.