Celice imunskega sistema, kot so celice T in B celice, imajo na svoji površini beljakovine, ki jim omogočajo, da prepoznajo tuje napadalce in jih napadejo. Območja teh beljakovin se lahko razlikujejo od celice do celice, kar jim omogoča, da se odzovejo na različne grožnje. Občasno nastanejo celice T in B celice, ki reagirajo na beljakovine, ki jih izražajo lastne celice telesa, imenovane avtoantigeni. Klonsko brisanje je proces, ki omogoča nevtralizacijo teh celic, preden se sprostijo v telo, kjer bi lahko začele napadati zdravo tkivo.
T celice nastajajo v kostnem mozgu, vendar zorijo v timusu, žlezi blizu srca, B celice pa nastajajo v kostnem mozgu. Kljub različnim krajem izvora oba tipa celic uporabljata podobno metodo klonske delecije, da zagotovita, da se zrele imunske celice, ki reagirajo na avtoantigene, ne sprostijo v krvni obtok. Med procesom zorenja te celice pridejo v stik z omejenim obsegom celic, kot so makrofagi in dendritične celice timusa. Te celice imajo različne površinske beljakovine, imenovane antigeni, ki jih predstavijo imunskim celicam, tako da je mogoče izločiti tiste celice, ki povzročajo reakcijo.
Če na primer uporabimo timus, dendritične celice timusa uporabljajo postopek predstavitve, ki omogoča T celicam, da poskušajo vezati površinske beljakovine, da jih pregledajo za klonsko brisanje. Nezrele T celice, ki reagirajo na te avtoantigene, tvorijo proteinski kompleks s celico timusa. V primeru, da nastane ta proteinski kompleks, sproži samouničevalno zaporedje, imenovano apoptoza, v celici T, da ta ne dozori in ne vstopi v telo, kjer bi lahko sprožila škodljiv odziv, če bi naletela na drugo celico z ta beljakovina.
Telo vsebuje številne druge vrste celic, razen tistih, ki jih vidimo v timusu in kostnem mozgu, zato mora klonska delecija upoštevati avtoantigene, ki jih običajno ne najdemo v teh tkivih. Timus to naredi tako, da ima timusne dendritične celice, ki vsebujejo površinske beljakovine, ki jih običajno najdemo drugje, na primer v tkivu trebušne slinavke. Nato se lahko pojavi klonska delecija pri imunskih celicah, ki bi običajno reagirale na te beljakovine trebušne slinavke, podoben proces pa uravnava B celice, ki zorijo v kostnem mozgu. Nekatera bolezenska stanja, kot je sladkorna bolezen, so lahko delno posledica neuspeha telesa, da predstavi celotno paleto telesnih antigenov dozorevajočim imunskim celicam, kar tem celicam omogoča zorenje in napad na zdravo tkivo.