Kimotripsin je prebavni encim, ki razgrajuje beljakovine v tankem črevesu. Sintetizira se kot večja molekula v trebušni slinavki in se prenaša v neaktivni obliki. Ko je v tankem črevesu, ga aktivira drug prebavni encim, tripsin.
Prebava hrane vključuje razgradnjo velikih molekul na majhne, ki se lahko absorbirajo v kri. Beljakovine so sestavljene iz verig aminokislin, ki so povezane s peptidnimi vezmi. Encimi so beljakovine, ki pospešujejo hitrost reakcij, proteaze pa pospešujejo razgradnjo beljakovin. V prebavi delujejo številne različne proteaze, ki delujejo na različne vrste in regije beljakovin.
Kimotripsin je vrsta proteaze, ki je v družini, znani kot serinske proteaze, znane tudi kot serinske endopeptidaze. To ime imajo, ker imajo na svojem aktivnem mestu aminokislino serin. Serinske proteaze se sintetizirajo v neaktivni, večji obliki, kar jim omogoča, da se transportirajo do mesta delovanja, ne da bi pri tem povzročile poškodbe tkiva. Neaktivna oblika kimotripsina je znana kot kimotripsinogen.
Po omejeni proteolizi s tripsinom, da se odcepi del kimotripsinogena, nastane dvomolekulska kombinacija kimotripsina. Dve molekuli se med seboj aktivirata, nato pa lahko katalizirata razgradnjo beljakovin. Kimotripsin ima prednost pri delovanju na določene vrste aminokislin. Nagiba se k razgradnji peptidne vezi z uporabo fenilalanina, triptofana ali tirozina. Vse to so aromatične aminokisline in so poimenovane tako, ker imajo v sebi ciklično obročno strukturo.
Mehanizem kimotripsina vključuje hidrolizo – razdelitev molekule vode na dva dela in dodajanje vsakega fragmenta drugemu delu peptidne vezi. To razcepi vez. Ko je ta proteaza razdrobljena, jo druge proteaze in peptidaze še naprej razgrajujejo, dokler se ne razgradi na aminokisline. Po končani prebavi v telesu obstaja razred naravnih zaviralcev serinske proteaze, imenovani serpini, ki inaktivirajo encime.
Mnoge rastline proizvajajo inhibitor kimotripsina. Zaviralci proteaze so na splošno še posebej pogosti v semenih stročnic in so lahko obrambni mehanizem pred žuželkami, ki omejujejo njihovo absorpcijo hranil. Poleg tega številne bakterije, ki živijo v našem črevesju, proizvajajo zaviralce proteaz proti prebavnim encimom, ki jim pomagajo preživeti, ne da bi jih prebavili.
Aktivnosti kimotripsina in tripsina se medicinsko preizkušajo za testiranje cistične fibroze in insuficience trebušne slinavke. Običajno se oba encima nahajata v blatu. Če niso, je indicirano nadaljnje testiranje.