Javna banka popkovnične krvi prejme darove popkovnične krvi in jo shrani za uporabo za ljudi, ki imajo določene zdravstvene motnje, ki jih je mogoče zdraviti z matičnimi celicami. Banka vodi evidenco o genetskih vidikih vsake donacije, tako da jo lahko natančno uskladi z ljudmi, ki morda potrebujejo zdravljenje. Lahko pa uporabi zbirke za raziskave izvornih celic; večina bank določa svoje dejavnosti. Donacija je neobvezna, omejena na nekaj bolnišnic in lahko stane dodaten denar. Javne banke tekmujejo z zasebnim bančništvom, kjer ljudje plačajo za odvzem in shranjevanje popkovnične krvi, če jo potrebujejo drugi družinski člani; ujemanje otroka z brati in sestrami ali drugimi družinskimi člani ni zagotovljeno.
Ker zasebno bančništvo ni zagotovilo za pridobitev potrebnih matičnih celic, večina zdravnikov namesto tega spodbuja uporabo javne banke popkovnične krvi. Družine morajo razumeti, da se z javnim darovanjem odrečejo vsakemu lastniškemu interesu za svojo popkovnično kri. Če bi jo kasneje potreboval sorodnik ali sorodnik novorojenčka, ne bi imel posebnih pravic do darovanja družine.
Pomanjkanje »lastništva« lahko nekatere ljudi odvrne od razmišljanja o javni banki popkovnične krvi. Številni zdravniki trdijo, da imajo javne donacije prednost, saj zagotavljajo veliko več potencialnih ujemanj kot ena ali dve shranjeni zbirki popkovnične krvi, in večina ljudi se bo bolje ujemala z javno banko kot zasebno trgovino. Zasebna donacija je tudi draga, z vnaprejšnjimi stroški nekaj tisoč ameriških dolarjev (USD) in letnimi stroški skladiščenja.
Na voljo je več javnih bank, čeprav ni niti približno dovolj, da bi zadovoljili potrebe po ljudeh z boleznimi, ki bi jih bilo mogoče zdraviti z matičnimi celicami, in družine lahko iščejo po svoji regiji ali državi, ali bližnja bolnišnica sodeluje z banko. Med porodom morajo sodelovati tudi porodničarji ali zdravniki družinske medicine. Kot smo že omenili, bo morda morala družina plačati del stroškov, ki običajno znašajo približno 100 USD ali nekoliko več, družine pa morajo preveriti pri javni banki popkovnične krvi ali porodničarju, ali se ta pristojbina uporablja.
Prav tako banke ne sprejemajo donacij vsake družine in vodijo ali prosijo porodničarja, da opravi temeljito zdravstveno anamnezo matere. Če je zdravje matere ali njena anamneza slaba, se donacije zavrnejo. Poleg tega se približno polovica vseh donacij zavrže zaradi stvari, kot je nezadostna količina.
Težko je financirati javno banko popkovnične krvi in to pojasnjuje, zakaj niso na voljo povsod. Tudi te banke se zanašajo na finančne donacije, vendar so mnoge od njih skromne in ne dobijo pozornosti, ki jo potrebujejo, da bi naredile več kot samo delovanje z majhnim proračunom. Ker se več razume o izvornih celicah, se je povečalo zanimanje za javno bančništvo, kar bi lahko povečalo javno podporo tem bankam, ki bi lahko neposredno ali z raziskavami ponudile življenjsko zdravljenje za ljudi z določenimi boleznimi.