Pri šolanju konj se nekateri lahko naučijo inteligentnega zavračanja, pri katerem se naučijo analizirati situacijo, da ugotovijo, ali je nevarna ali ne, in ustrezno ukrepati. Konj, ki se je naučil inteligentnega zavračanja, ne bo storil nečesa, kar se mu zdi nevarno. Ta tehnika usposabljanja se uporablja tudi za usposabljanje službenih živali, kot so psi vodniki.
Konji so po naravi inteligentne, občutljive živali, čeprav so nekatere pasme lahko nekoliko visoko napete. Tako kot mnogi kopitarji imajo tudi oni zelo prefinjen občutek za nevarnost, zahvaljujoč tisočletju kot plen večjim živalim. Prav tako so naravnani na majhne spremembe v naravnem okolju, ki bi lahko signalizirale stvari, kot so nestabilna tla, nevaren led ali ohlapno zakoreninjena drevesa, ki bi lahko padla. Ko je inteligentno zavračanje vključeno v program usposabljanja, izkorišča te naravne lastnosti konja.
Poleg zaščite dobrega počutja živali inteligentna zavrnitev ščiti tudi njenega vodnika. V primeru psov vodnikov na primer pes ne bo prečkal ulice, ko ni varno. V primeru konja lahko inteligentna zavrnitev vključuje ne previsok skok ali zavračanje prebosti ali plavanja po reki z nevarnim tokom. Konj, ki se je naučil inteligentnega zavračanja, bo varnejši in varnejši konj, zlasti za mlajše in bolj neizkušene jahače.
Nekateri konji, zlasti poniji, so prirojeno pametni glede nevarnosti potencialnih dejavnosti, in načela inteligentnega zavračanja ni treba učiti, ker konj preprosto noče početi nevarnih stvari po naravi. V nekem smislu bi lahko inteligentno zavrnitev razumeli kot zdravo pamet za konje. V primeru ponijev se morajo jahači naučiti razlikovati med inteligentno zavračanjem in preprosto željo, da nečesa ne storijo, čeprav dobro izurjen poni ne bi smel zavrniti varnega ukaza, ko je bil dan.
Koncept inteligentne zavrnitve je pogosto vključen v naravno jahanje in druge celostne tehnike treninga konj. Predpostavlja, da konji ne bi smeli prezreti svoje prirojene inteligence in stoletne evolucije, ter da bi lahko bila aktivna odločitev konja, da bo pameten v določeni situaciji, zelo koristna. Medtem ko imajo konji zgodovino inteligentnega zavračanja v ekstremnih okoliščinah, ga trenerji poskušajo izpopolniti in konja naučijo, da je v določenih situacijah primerno prezreti ali zavrniti ukaz.