Industrijska fermentacija je enak postopek, ki ga gospodinjski peki uporabljajo pri nanašanju kvasa na kruh, vendar v veliko večjem obsegu. Ta postopek fermentira določene materiale v uporabne produkte z uporabo mikroorganizmov, ogljika, dušika, kisika in vira energije za pogon fermentacije. To se običajno izvaja za živilske izdelke, vendar se industrijska fermentacija izvaja tudi v farmacevtski industriji in pri odstranjevanju odplak. Največja razlika med običajno fermentacijo in industrijsko sorto je v tem, da se za proizvodnjo velike fermentacije uporabljajo velike fermentacijske enote.
Fermentacija, ne glede na to, ali gre za gospodinjsko ali industrijsko fermentacijo, je dejanje oksidacije organskih spojin za proizvodnjo nove komponente. Za ustvarjanje tega učinka mora biti prisotnih več naravnih elementov. Fermentacija zahteva vir ogljika, kot je sladkor; vir dušika, kot so beljakovine ali nitrati; kisik; in vir energije, kot je toplota ali tlak. Ko se ti združijo, naravni proces fermentacije razgradi sestavine materialov in jih spremeni v nekaj uporabnega.
Industrijska fermentacija za hrano je ena najbolj očitnih uporab fermentacije. Vsi alkoholi zahtevajo fermentacijo, da se alkohol razvije. Sir zahteva, da se mlečni izdelki starajo in fermentirajo, preden pridobijo lastnosti sira. Obstaja tudi veliko aplikacij za peko, kot je priprava večine kruha, ki zahteva tudi fermentacijo.
Farmacevtska industrija zahteva fermentacijo za ustvarjanje številnih zdravil. Na primer, vsi antibiotiki na osnovi penicilina zahtevajo fermentacijo penicilina, da postane antibiotik učinkovit. Enako velja za ustvarjene hormone, kot so inzulin in medicinski steroidi, ter vitamine in aminokisline v beljakovinskih ploščicah.
Odstranjevanje odplak uporablja industrijsko fermentacijo z razgradnjo trdnih odplak v neškodljive materiale, ki se lahko uporabijo kot gnojilo. Bakterije se vnesejo v odplake in jih začnejo jesti, dokler odplake niso topne in neškodljive. Čeprav je fermentacija odplak učinkovita, traja dolgo časa.
Če primerjamo industrijsko fermentacijo z drugimi oblikami fermentacije, je zelo majhna razlika, ker oba uporabljata iste biološke procese. Najpogosteje se pri fermentaciji v industrijskem obsegu uporablja stroj, imenovan fermenter, ki je dovolj velik, da prilega velike količine komponent. Ti stroji so narejeni tako, da ohranjajo materiale v pravilnih pogojih, da se zagotovi neprekinjena fermentacija. Fermenterji se najpogosteje uporabljajo pri farmacevtski fermentaciji, vendar se za peko fermentacija uporablja tudi oprema.