Idiotip je niz aminokislin, ki so edinstvene za protitelo in ki določajo njegovo specifičnost – z drugimi besedami, na katere antigene se bo vezalo. Študija idiotipov je pomembna za imunologe, ki morajo razumeti, kako telo proizvaja in uporablja protitelesa. Pri izdelavi cepiva je mogoče izkoristiti idiotipe, da bi spodbudili bolnika, da začne proizvajati ustrezna protitelesa in zagotoviti zaščito pred določenimi antigeni. Te aminokisline je mogoče zaporediti v laboratorijskem okolju.
Te strukture se pogosto nahajajo na ali blizu mesta vezave antigena, na delu protitelesa, znanem kot regija, ki določa komplementarnost (CDR) ali hipervariabilna regija. Eno protitelo ima lahko več idiotipov. Idiotip je izjemno specifičen – tako zelo, da se ljudje včasih lahko odzovejo na lastne idiotipe in se bodo zagotovo odzvali na tiste, ki so jih uvedli drugi ljudje ali vrste. Če se to naredi namerno s cepivom, lahko spodbudi imunski sistem k proizvodnji protiteles, da se upre nalezljivim boleznim.
To je ena od metod za razvrščanje protiteles. Na nekoliko širši ravni lahko protitelesa razvrstimo glede na alotip, genetske variacije v strukturi protiteles, ki lahko odražajo genetsko dediščino. Tesno sorodni ljudje imajo ponavadi podobne alotipe, vendar lahko reagirajo proti alotipom, ki nastanejo v telesih ljudi, ki niso v sorodu. To je lahko težava pri postopkih, kot so transfuzije krvi, pri katerih je ujemanje protiteles ključnega pomena za preprečevanje neželenih učinkov.
Še širše je mogoče protitelesa razvrstiti glede na izotip, značilnost, ki jo opazimo pri vseh pripadnikih iste vrste. Imunoglobulin M je na primer človeški izotip, beljakovina, ki jo najdemo v vsaki osebi, razen pri tistih, ki imajo genetsko motnjo, ki oslabi imunsko funkcijo. Progresivna klasifikacija protiteles lahko pomaga raziskovalcem, ko preučujejo protitelesa in njihove funkcije.
Idiotip je zelo edinstven; samo protitelesa, ki imajo identično specifičnost, bodo imela enak idiotip, vendar imajo lahko protitelesa z različnimi specifičnostmi enake izotipe in alotipe. Raziskovalci lahko uporabijo laboratorijsko testiranje, da prepoznajo določene idiotipe v vzorcu in jih zaporedijo, da izvedejo več o njihovem delovanju. Laboratorijske živali je mogoče uporabiti za izdelavo človeških idiotipov določene specifičnosti za uporabo pri raziskavah in razvoju novih cepiv. Različice idiotipov lahko tudi pojasnijo, zakaj imajo ljudje morda protitelesa proti enemu sevu bolezni, drugim pa ne, ker se ne morejo zakleniti na antigene, s katerimi niso zasnovani za seznanjanje, kot se vidi v primerih gripe.